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Enregistrement W2162457674 · doi:10.1093/jac/dks455

Role and evolution of viral tropism in patients with advanced HIV disease receiving intensified initial regimen in the ANRS 130 APOLLO trial

2012· article· en· W2162457674 sur OpenAlexaff
C. Charpentier, Véronique Joly, Lucile Larrouy, Catherine Fagard, Benoît Visseaux, N Colin De Verdière, François Raffi, P. Yéni, D. Descamps, Hugues Aumaître, M. Médus, S. Neuville, Sophie Abgrall, M. Bentata, O. Bouchaud, Johann Cailhol, Hugues Cordel, R. Dhôte, Hélène Gros, P. Honore-Berlureau, Tien Huynh, A Krivitzky, Reza Mansouri, M. Poupard, Virginie Prendki, Deepti Radia, F. Rougès, F. Touam, B. Warde, Nathalie De Castro, Nathalie Verdière, J. Delgado, Samuel Ferret, S. Gallien, T. Kandel, Matthieu Lafaurie, Magali Lagrange, C. Lascoux-Combe, Dung T. Le, Jean‐Michel Molina, J. Pavie, Claire Pintado, D. Ponscarme, A. Rachline, W. Rozenbaum, D Séréni, Olivier Tauléra, J.M. Estavoyer, Jean‐François Faucher, Adeline Foltzer, Bruno Hoën, Laurent Hustache‐Mathieu, M. Dupon, H. Dutronc, D. Neau, J. M. Ragnaud, I. Raymond, S. Boucly, Olivier Lortholary, J.-P. Viard, Carlos F. Bechara, J. F. Delfraissy, Jade Ghosn, Cécile Goujard, W. Kamouh, M.Leonard Mole, Yann Quertainmont, Jean‐François Bergmann, Éric Boulanger, Hernán Del Castillo, Maguy Parrinello, A. Rami, Pierre‐Olivier Sellier, G. Lepeu, G. Pichancourt, Lise Bernard, Huguette Berthé, J. Clarissou, M. Gory, J.C. Melchior, Christian Perronne, Sophia Stegman, P. de Truchis, Ouda Derradji, M. Malet, E. Teicher, Daniel Vittecoq, Catherine Chakvetadze, Christophe Fontaine, Tuna Lukiana, G Pialloux, Laurence Slama, Delphine Bonnet, Soraya Boucherit, Neila Talbi, Isabelle Fournier, Annie Gervais, L. Iordache, J Laurichesse, C. Leport, Golriz Pahlavan, Bao-Chau Phung, N. Bennamar, A. Brunet, L. Guillevin, Dominique Salmon‐Céron, Tassadit Tahi, Stéphanie Dominguez, P Jouve, Jean‐Daniel Lelièvre, Yaniv Levy, Giovanna Melica, A Sobel, Saoussen Ben Abdallah, Manuela Bonmarchand, F. Bricaire, S. Herson, Malika Iguertsira, Christine Katlama, H. Kouadio, Lars Schneider, Anne Simon, M. A. Valantin, Sylvie Abel, V. Beaujolais, André Cabie, B. Liauthaud, Sylvie François, P. Abgueguen, Jean-Marie Chennebault, Jocelyne Loison, É. Pichard, V. Rabier, J. Delaune, I. Louis, Philippe Morlat, M. C. Pertusa, F. Brunel-Delmas, Pierre Chiarello, François Jeanblanc, Jean-Pierre Jourdain, J. M. Livrozet, Djamila Makhloufi, J. L. Touraine, C. Augustin-Normand, F. Bailly, N. Benmakhlouf, C. Brochier, L. Cotte, V. Guéripel, Kouamé Koffi, Philippe Lack, Bertrand Lebouché, M. Maynard, P. Miailhes, Sylvie Radenne, I. Schlienger, V. Thoirain, C. Trépo, Marie‐Pierre Drogoul, Gabin Fabre, V. Frixon-Marin, J.A. Gastaut, Eric Peyrouse, I. Poizot-Martin, Jeanne‐Marie Jacquet, G. Le Facher, Corinne Merle De Boever, J. Reynes, Christine Tramoni, C. Allavena, Éric Billaud, Charlotte Biron, B. Bonnet, Sabelline Bouchez, David Boutoille, C. Brunet‐François, H. Hue, O. Mounoury, Véronique Reliquet, O Aubry, J.-L. Esnault, Sophie Leautez-Nainville, Philippe Van de Perre, Isabelle Suaud, S Bréaud, C Ceppi, P. Dellamonica, F. De Salvador, J. Durant, Stephen J. Ferrando, J.G. Fuzibet, A. Leplatois, V. Mondain, I. Perbost, Pellegrina Pugliese, V. Rahelinirina, É. Rosenthal, F. Sanderson, M. Vassalo, C. Arvieux, J.-M. Chapplain, C. Michelet, M. Ratajczak, M. Revest, Faouzi Souala, P. Tattevin, Geneviève Chêne, P Fischer, J.-M. Lang, M Partisani, D. Rey, Frédéric Bastides, Jean‐Marc Besnier, P. Le Bret, P. Choutet, J. F. Dailloux, P. Guadagnin, Pascale Nau, J. Rivalain, A. Soufflet, E Aïssi, H. Melliez, S. Pavel, Y Mouton, Y. Yazdanpanah, L. Boyer, C. Burty, L. Letranchant, T. May, S. Wassoumbou, L. Blum, O. Danne, M. A. Arthus, Patrick A. Dion, Agnès Certain, Sophie Tabuteau, Aurélie Beuscart, Nouara Agher, Anne Frosch, Sandrine Couffin-Cadièrgues, Alpha Diallo

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensHotel Dieu Hospital
Organismes subventionnairesVlaamse regering
Mots-clésEnfuvirtideTropismMaravirocVirologyTissue tropismBiologyRegimenMedicineImmunologyInternal medicineHuman immunodeficiency virus (HIV)VirusGp41

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: The aims of the study were to assess in patients with advanced HIV disease receiving antiretroviral therapy (ART) intensification with enfuvirtide (i) resistance at virological failure (VF), (ii) impact of baseline tropism on immunovirological response, and (iii) HIV-1 DNA tropism evolution during ART. METHODS: The ANRS 130 APOLLO randomized trial evaluated in naive patients the immunovirological impact of standard ART without (control arm) or with enfuvirtide. Tropism was determined on RNA and DNA by V3-loop sequencing interpreted using the Geno2Pheno algorithm. RESULTS: At baseline the median CD4 cell count was 30 cells/mm(3). Among the 170 patients assessable in this virological substudy, HIV-1 RNA tropism was as follows: 60% of viruses were R5 and 40% were R5X4/X4. HIV-1 DNA tropism was as follows: 54% were R5 and 46% were R5X4/X4. At week 24, 39% and 49% of patients experienced VF in the enfuvirtide and control arms, respectively. In the enfuvirtide arm, only resistance-associated mutations to enfuvirtide were detected. In the control arm, two patients displayed drug-resistant viruses at the time of VF. No impact of baseline tropism was observed on immunovirological response, regardless of the study arm. Among the 25 patients experiencing DNA tropism switch between baseline and week 24, 16 (64%) switched from R5 to R5X4/X4. These latter were mostly successfully suppressed patients receiving enfuvirtide and exhibiting poorer immunological response. CONCLUSIONS: Baseline RNA tropism had no impact on the immunovirological response. Drug resistance mutations were only detected for the fusion inhibitor. Finally, the mechanism of replenishment of the viral cellular reservoir with X4 viruses observed needs to be further analysed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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