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Enregistrement W2162490746 · doi:10.1093/jnci/dju267

The Effect on Melanoma Risk of Genes Previously Associated With Telomere Length

2014· article· en· W2162490746 sur OpenAlexfundno aff
Mark M. Iles, D. Timothy Bishop, John Taylor, Nicholas K. Hayward, Myriam Brossard, Anne Ε. Cust, Alison M. Dunning, Jeffrey E. Lee, Eric K. Moses, Lars A. Akslen, Per Arne Andresen, Marie‐Françoise Avril, Esther Azizi, Giovanna Bianchi‐Scarrà, Kevin M. Brown, Tadeusz Dębniak, David E. Elder, Eitan Friedman, Paola Ghiorzo, Elizabeth M. Gillanders, Alisa M. Goldstein, Nelleke A. Gruis, Johan Hansson, Mark Harland, Per Helsing, Marko Hočevar, Veronica Höiom, Christian Ingvar, Peter A. Kanetsky, Maria Teresa Landi, Julie Lang, G.M. Lathrop, Jan Lubiński, Rona M. MacKie, Nicholas G. Martin, Anders Molven, Grant W. Montgomery, Srdjan Novaković, Håkan Olsson, Susana Puig, Joan Anton Puig‐Butille, Graham Radford‐Smith, Juliette A. Randerson‐Moor, Nienke van der Stoep, Remco van Doorn, David C. Whiteman, Stuart MacGregor, Karen A. Pooley, Sarah V. Ward, Graham J. Mann, Christopher I. Amos, Paul D.P. Pharoah, Florence Démenais, Matthew H. Law, Julia Newton‐Bishop, Jennifer H. Barrett

Notice bibliographique

RevueJNCI Journal of the National Cancer Institute · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTelomeres, Telomerase, and Senescence
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteCancer Council QueenslandCancer Council NSWMedical Research CouncilUniversity of Texas MD Anderson Cancer CenterNational Institutes of HealthHaukeland UniversitetssjukehusAssistance publique-Hôpitaux de ParisAgència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de RecercaNational Health and Medical Research CouncilInstitut National Du CancerInstituto de Salud Carlos IIIMelanoma Institute AustraliaUniversitat de BarcelonaKreftforeningenUniversité Paris DescartesUniversitetet i BergenMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaUniversità degli Studi di GenovaLunds UniversitetCancer Institute NSWCancerfondenCancer AustraliaAustralian Research CouncilPerelman School of Medicine, University of PennsylvaniaUniversiteit LeidenNational Cancer InstituteAustralian Cancer Research FoundationKarolinska InstitutetCancer Council VictoriaUniversity of GlasgowEuropean CommissionWellcome TrustCancer Research UKWestmead Millennium Institute for Medical ResearchMcGill UniversityUniversity of PennsylvaniaQIMR Berghofer Medical Research InstitutePomorski Uniwersytet Medyczny W SzczecinieDartmouth CollegeMelanoma Research Alliance
Mots-clésTelomereSingle-nucleotide polymorphismGermlineMelanomaConfoundingBiologyGeneticsCancerCase-control studyGenotypeGeneOncologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Telomere length has been associated with risk of many cancers, but results are inconsistent. Seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) previously associated with mean leukocyte telomere length were either genotyped or well-imputed in 11108 case patients and 13933 control patients from Europe, Israel, the United States and Australia, four of the seven SNPs reached a P value under .05 (two-sided). A genetic score that predicts telomere length, derived from these seven SNPs, is strongly associated (P = 8.92x10(-9), two-sided) with melanoma risk. This demonstrates that the previously observed association between longer telomere length and increased melanoma risk is not attributable to confounding via shared environmental effects (such as ultraviolet exposure) or reverse causality. We provide the first proof that multiple germline genetic determinants of telomere length influence cancer risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations117
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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