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Enregistrement W2162491971 · doi:10.1212/01.wnl.0000291779.35643.15

Distal truncation of KCC3 in non–French Canadian HMSN/ACC families

2007· article· en· W2162491971 sur OpenAlexafffundabout
Adèle Salin‐Cantegrel, Jean‐Baptiste Rivière, Nicolas Dupré, François Charron, Masoud Shekarabi, Liliane Karemera, Cláudia Gaspar, J. Horst, Mustafa Tekin, G. Deda, Amanda Krause, M. M. Lippert, M Willemsen, R. Jarrar, J. Y. Lapointe, Guy A. Rouleau

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFetal and Pediatric Neurological Disorders
Établissements canadiensHôpital de l'Enfant-Jésus
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchRadboud Universiteit
Mots-clésHereditary motor and sensory neuropathyAgenesis of the corpus callosumGeneticsMutationPopulationExonBiologyHaplotypeMissense mutationMutantGeneGenotypeMedicineCorpus callosumAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<b>Background: </b> Hereditary motor and sensory neuropathy with agenesis of the corpus callosum (HMSN/ACC) is a severe and progressive autosomal recessive polyneuropathy. Mutations in the potassium-chloride cotransporter 3 gene (<i>KCC3</i>) were identified as responsible for HMSN/ACC in the French Canadian (FC) population. In the present study, the authors were interested in finding new mutations in non-FC populations, assessing the activity of mutant proteins and refining genotype-phenotype correlations. <b>Methods: </b> The authors screened <i>KCC3</i> for mutations using direct sequencing in six non-FC HMSN/ACC families. They then assessed the functionality of the most common mutant protein using a flux assay in <i>Xenopus laevis</i> oocytes. <b>Results: </b> The authors identified mutations in exon 22 of KCC3: a novel mutation (del + 2994-3003; E1015X) in one family, as well as a known mutation (3031C→T; R1011X) found in five unrelated families and associated with two different haplotypes. The function of the cotransporter was abolished, although a limited amount of mutant proteins were correctly localized at the membrane. <b>Conclusions: </b> KCC3 mutations in exon 22 constitute a recurrent mutation site for hereditary motor and sensory neuropathy with agenesis of the corpus callosum (HMSN/ACC), regardless of ethnic origin, and are the most common cause of HMSN/ACC in the non–French Canadian (FC) families analyzed so far. Therefore, for genetic analysis, exon 22 screening should be prioritized in non-FC populations. Finally, the R1011X mutation leads to the abrogation of KCC3’s function in <i>Xenopus laevis</i> oocytes, likely due to impaired transit of the cotransporter. <b>GLOSSARY: </b><b>ANOVA</b> = analysis of variance; <b>CTD</b> = C-terminal domain; <b>FC</b> = French Canadian population; <b>HMSN/ACC</b> = hereditary motor and sensory neuropathy with agenesis of the corpus callosum; <b>KCC3</b> = potassium-chloride cotransporter 3; <b>mut</b> = mutated sequence; <b>NGS</b> = normal goat serum; <b>RVD</b> = regulatory volume decrease; <b>WT</b> = wild type sequence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,171
Score d'incertitude au seuil0,933

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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