Resistance profile of Bacteroides fragilis isolated in Brazil. Do they shelter the cfiA gene?
Notice bibliographique
Résumé
The epidemiology of antimicrobial resistance of clinical isolates and human intestinal strains of Bacteroides fragilis has assumed great importance in the last few years since this microorganism, like other members of the B. fragilis group, can be responsible for the spread of resistance determinants. It is possible that the presence of B. fragilis in polluted aquatic environments might contribute to the spread of resistance. The antimicrobial resistance profile of 44 clinical B. fragilis strains isolated from 1981-1988 and 1991-1998 from the University hospital of Rio de Janeiro, and of 17 faecal and 17 polluted aquatic environmental B. fragilis strains isolated between 1991 and 1998 was determined. The susceptibility tests against penicillin, cefoxitin, imipenem, meropenem, clindamycin, chloramphenicol and metronidazole were performed by Etest in Wilkins-Chalgren agar enriched with 5% sheep blood. Motivated by some high MIC values for cefoxitin and meropenem, the cfiA gene, which codes for a metallo-beta-lactamase, was investigated among all strains, using PCR amplification. The resistance to penicillin was high in the samples from 1981 to 1988 (92.9%) and also in those from 1991 to 1998 (100%), although the MIC90 decreased from 256 mg/L to 24 mg/L. An increase in the resistance level to clindamycin and cefoxitin was seen from one decade to the other, the MIC90 values changing from 4 mg/L to 12 mg/L and from 8 mg/L to 32 mg/L, respectively. The susceptibility profile for metronidazole, chloramphenicol, imipenem and meropenem remained stable, although two clinical strains showed MICs of 6 mg/L and 8 mg/L against meropenem. Almost all human intestinal strains were resistant to penicillin and all of them were susceptible to imipenem, meropenem, chloramphenicol and metronidazole. The MICs of meropenem against two strains isolated from a polluted aquatic environment were 6 mg/L and 32 mg/L. The cfiA gene was detected in five strains, two of which were isolated from clinical specimens against which the MIC values of cefoxitin were high and three from an aquatic environment, whose susceptibility to both cefoxitin and meropenem ranged from sensitive to resistant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».