A novel group of multi‐GAP‐domain proteins
Notice bibliographique
Résumé
The Rho GTPase-activating proteins (RhoGAPs) play an essential role in regulating various cellular processes. Rat tGAP1 is the first reported protein that has multiple GAP domains. It is exclusively expressed in male germ cells. However, tGAP1 does not possess GAP activities in vitro. No tGAP1 homology has been identified in other species. In this study, we searched the genomic databases and identified many genes whose protein products possess 2-4 GAP domains in rat, mouse and dog. These genes all showed sequence similarity to tGAP1. The rat tGAP gene loci all locate on chromosome 2 and are all expressed in testes in RT-PCR analysis. The mouse tGAP gene loci also clustered on chromosome 3 but RT-PCR analysis showed most are pseudogene loci. Multiple sequence alignment showed that many conserved residues of the "arginine finger" motif within the GAP domains of predicted tGAP proteins have mutated, suggesting that tGAP proteins do not possess GAP activity. We also elucidated the evolutionary relations among the rat tGAP genes. Based on the phylogenetic analysis data, we proposed that tGAP genes and Arhgap20 genes have a common ancestor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».