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Enregistrement W2162663437 · doi:10.1259/bjr.20150269

An online open-source tool for automated quantification of liver and myocardial iron concentrations by T2* magnetic resonance imaging

2015· article· en· W2162663437 sur OpenAlexaboutno aff
Kim-Ann Git, Luciana A Fioravante, Juliano Lara Fernandes

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Radiology · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésMedicineConfidence intervalMagnetic resonance imagingNuclear medicineCorrelation coefficientInternal medicineRadiologyStatisticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To assess whether an online open-source tool would provide accurate calculations of T2(*) values for iron concentrations in the liver and heart compared with a standard reference software. METHODS: An online open-source tool, written in pure HTML5/Javascript, was tested in 50 patients (age 26.0 ± 18.9 years, 46% males) who underwent T2(*) MRI of the liver and heart for iron overload assessment as part of their routine workup. Automated truncation correction was the default with optional manual adjustment provided if needed. The results were compared against a standard reference measurement using commercial software with manual truncation (CVI(42)(®) v. 5.1; Circle Cardiovascular Imaging; Calgary, AB). RESULTS: The mean liver T2(*) values calculated with the automated tool was 4.3 ms [95% confidence interval (CI) 3.1 to 5.5 ms] vs 4.26 ms using the reference software (95% CI 3.1 to 5.4 ms) without any significant differences (p = 0.71). In the liver, the mean difference was 0.036 ms (95% CI -0.1609 to 0.2329 ms) with a regression correlation coefficient of 0.97. For the heart, the automated T2(*) value was 26.0 ms (95% CI 22.9 to 29.0 ms) vs 25.3 ms (95% CI 22.3 to 28.3 ms), p = 0.28. The mean difference was 0.72 ms (95% CI 0.08191 to 1.3621 ms) with a correlation coefficient of 0.96. CONCLUSION: The automated online tool provides similar T2(*) values for the liver and myocardial iron concentrations as compared with a standard reference software. ADVANCES IN KNOWLEDGE: The online program provides an open-source tool for the calculation of T2(*) values, incorporating an automated correction algorithm in a simple and easy-to-use interface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,016
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,016
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,009

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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