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Enregistrement W2162722833 · doi:10.1042/0264-6021:3540387

A member of the nuclear factor-1 family is involved in the pituitary repression of the human placental growth hormone genes

2001· article· en· W2162722833 sur OpenAlexafffund
Lisa Norquay, Yan Jin, Rama Mohan Surabhi, R. Daniel Gietz, Naoko Tanese, Peter A. Cattini

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research Council CanadaMedical Research CouncilManitoba Health Research Council
Mots-clésBiologyGenePromoterMolecular biologyPsychological repressionLocus (genetics)SyncytiotrophoblastGene expressionGeneticsPlacentaFetus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human growth hormone (GH) gene family consists of five tandemly arranged and highly related genes, including the chorionic somatomammotropins (CSs), at a single locus on chromosome 17. Despite striking homologies in promoter and flanking DNA sequences, the genes within this locus have different tissue-specific patterns of expression: GH-N is expressed almost exclusively in the somatotrophs of the anterior pituitary; the remaining genes, including CS-A, are expressed in placental syncytiotrophoblast. Previously we proposed that active repression of the placental gene promoters in pituitary GC cells is mediated by upstream 'P' sequences and, specifically, a 263 bp region containing two 'P' sequence elements (PSE-A and PSE-B) and corresponding factors (PSF-A and PSF-B). We have now examined the possibility that PSF-A and PSF-B are members of the nuclear factor (NF)-1 family. Transcripts of NF-1A, NF-1C and NF-1X, but not of NF-1B, were readily detected in GC cells. High-affinity binding of NF-1 to PSE-B, but not to PSE-A, was confirmed by competition of DNA-protein interactions by using NF-1 DNA elements and antibodies. Functionally, a NF-1 element was able to substitute for PSE-B as a promoter-specific repressor in GC cells after gene transfer. However, there was a difference in the magnitude of repression exerted by the NF-1 and PSF-B elements on the CS-A promoter and, with the use of mutations, this difference was shown to be consistent with variations in NF-1-binding sequences. These results indicate that PSF-B, but not PSF-A, is a member of the NF-1 family, which participates in the PSF complex and in the repression of the CS-A promoter in pituitary GC cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,200

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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