MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2162791356 · doi:10.1128/aem.70.5.2639-2646.2004

In Vivo Synthesis of Mammalian-Like, Hybrid-Type N-Glycans in<i>Pichia pastoris</i>

2004· article· en· W2162791356 sur OpenAlexfundno aff
Wouter Vervecken, V. A. Kaigorodov, Nico Callewaert, Steven Geysens, Kristof De Vusser, Roland Contreras

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesVlaamse regeringUniversiteit GentFonds Wetenschappelijk OnderzoekMcGill University
Mots-clésPichia pastorisGlycosylationGolgi apparatusGlycoproteinGlycanEndoplasmic reticulumMannoseBiochemistryN-linked glycosylationSecretory pathwayChemistryCell biologyRecombinant DNABiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Pichia pastoris N-glycosylation pathway is only partially homologous to the pathway in human cells. In the Golgi apparatus, human cells synthesize complex oligosaccharides, whereas Pichia cells form mannose structures that can contain up to 40 mannose residues. This hypermannosylation of secreted glycoproteins hampers the downstream processing of heterologously expressed glycoproteins and leads to the production of protein-based therapeutic agents that are rapidly cleared from the blood because of the presence of terminal mannose residues. Here, we describe engineering of the P. pastoris N-glycosylation pathway to produce nonhyperglycosylated hybrid glycans. This was accomplished by inactivation of OCH1 and overexpression of an alpha-1,2-mannosidase retained in the endoplasmic reticulum and N-acetylglucosaminyltransferase I and beta-1,4-galactosyltransferase retained in the Golgi apparatus. The engineered strain synthesized a nonsialylated hybrid-type N-linked oligosaccharide structure on its glycoproteins. The procedures which we developed allow glycan engineering of any P. pastoris expression strain and can yield up to 90% homogeneous protein-linked oligosaccharides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,509

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations184
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueApplied and Environmental MicrobiologyMême sujetGlycosylation and Glycoproteins ResearchTravaux en français237 207