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Enregistrement W2162816841 · doi:10.1128/jb.187.15.5470-5481.2005

Functional Analysis of Conserved Gene Products Involved in Assembly of<i>Escherichia coli</i>Capsules and Exopolysaccharides: Evidence for Molecular Recognition between Wza and Wzc for Colanic Acid Biosynthesis

2005· article· en· W2162816841 sur OpenAlexaff
Anne N. Reid, Chris Whitfield

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesU.S. Consumer Product Safety Commission
Mots-clésBiologyBiochemistryAmino acidEscherichia coliTyrosineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Group 1 capsular polysaccharides (CPSs) of Escherichia coli and some loosely cell-associated exopolysaccharides (EPSs), such as colanic acid, are assembled by a Wzy-dependent polymerization system. In this biosynthesis pathway, Wza, Wzb, and Wzc homologues are required for surface expression of wild-type CPS or EPS. Multimeric complexes of Wza in the outer membrane are believed to provide a channel for polymer export; Wzc is an inner membrane tyrosine autokinase and Wzb is its cognate phosphatase. This study was performed to determine whether the Wza, Wzb, and Wzc proteins for colanic acid expression in E. coli K-12 could function in the E. coli K30 prototype group 1 capsule system. When expressed together, colanic acid Wza, Wzb, and Wzc could complement a wza-wzb-wzc defect in E. coli K30, suggesting conservation in their collective function in Wzy-dependent CPS and EPS systems. Expressed individually, colanic acid Wza and Wzb could also function in K30 CPS expression. In contrast, the structural requirements for Wzc function were more stringent because colanic acid Wzc could restore translocation of K30 CPS to the cell surface only when expressed with its cognate Wza protein. Chimeric colanic acid-K30 Wzc proteins were constructed to further study this interaction. These proteins could restore K30 biosynthesis but were unable to couple synthesis to export. The chimeric protein comprising the periplasmic domain of colanic acid Wzc was functional for effective K30 CPS surface expression only when coexpressed with colanic acid Wza. These data highlight the importance of Wza-Wzc interactions in group 1 CPS assembly.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,073
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations108
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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