Kinetics of the reaction catalyzed by inositol dehydrogenase from <i>Bacillus</i> <i>subtilis</i> and inhibition by fluorinated substrate analogs
Notice bibliographique
Résumé
Inositol dehydrogenase (EC 1.1.1.18) from Bacillus subtilis catalyzes the oxidation of myo-inositol to scyllo-inosose by transfer of the equatorial hydride of the substrate to NAD + . This is a key enzyme in the metabolism of myo-inositol, a primary carbon source for soil bacteria. In light of our recent discovery that the enzyme has a broad substrate spectrum while maintaining high stereoselectivity, we seek a more thorough understanding of the enzyme and its active site. We have examined the kinetics of the recombinant enzyme, and synthesized fluorinated substrate analogues as competitive inhibitors. We have evaluated all rate constants in the ordered, sequential Bi Bi mechanism. No steady-state kinetic isotope effect is observed using myo-[2- 2 H]-inositol, indicating that the chemical step of the reaction is not rate-limiting. We have synthesized the substrate analogs 2-deoxy-2-fluoro-myo-inositol, its equatorial analog 1-deoxy-1-fluoro-scyllo-inositol, the gem-difluorinated analog 1-deoxy-1,1-difluoro-scyllo-inositol, and the sugar analog α-D-glucosyl fluoride. Of these, 1-deoxy-1-fluoro-scyllo-inositol showed no inhibition, while all others tested had K i values comparable to the K m values of the analogous substrates myo-inositol and α-D-glucose.Key words: inositol dehydrogenase, enzyme mechanism, kinetics, competitive inhibitor, substrate analogue.
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».