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Enregistrement W2163059013 · doi:10.1039/b716863b

Coordination properties of Cu(<scp>ii</scp>) and Ni(<scp>ii</scp>) ions towards the C-terminal peptide fragment -TYTEHA- of histone H4

2007· article· en· W2163059013 sur OpenAlexaff
Tilemachos Karavelas, Γεράσιμος Μαλανδρίνος, Nick Hadjiliadis, Piotr Młynarz, Henryk Kozłowski, M. Barsam, Ian S. Butler

Notice bibliographique

RevueDalton Transactions · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryImidazoleDeprotonationPeptideAmideHistidineStereochemistryCationic polymerizationHistone H4CrystallographyHydrolysisElectron paramagnetic resonanceOctahedronMedicinal chemistryIonHistoneAmino acidPolymer chemistryBiochemistryDNAOrganic chemistryCrystal structure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In order to reveal more information about the toxicity caused by metals and furthermore their influence to the physiological metabolism of the cell, the hexapeptide model Ac-ThrTyrThrGluHisAla-am representing the C-terminal 71-76 fragment of histone H4 which lies into the nucleosome core, was synthesized. A combined pH-metric and spectroscopic UV-VIS, EPR, CD and NMR study of Ni(II) and Cu(II) binding to the blocked hexapeptide, revealed the formation of octahedral complexes involving imidazole nitrogen of histidine, at pH 5 and pH 7 for Cu(II) and Ni(II) ions respectively. In basic solutions a major square-planar 4 N Ni(II)-complex, adopting a {N(Im), 3N(-)} coordination mode, was formed. In the case of Cu(II) ions, a 3 N complex, involving the imidazole nitrogen of histidine and two deprotonated amide nitrogens of the backbone of the peptide, at pH 7 and a series of 4 N complexes starting at pH 6.5, were suggested. In addition Ni(II)-mediated hydrolysis of the peptide bond-Tyr-Thr was evident following our experimental data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,760

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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