Probing Receptor Binding Activity of Interleukin-8 Dimer Using a Disulfide Trap
Notice bibliographique
Résumé
Interleukin-8 (IL-8), a member of the chemokine superfamily, exists as both monomers and dimers, and mediates its function by binding to neutrophil CXCR1 and CXCR2 receptors that belong to the G protein-coupled receptor class. It is now well established that the monomer functions as a high-affinity ligand, but the binding affinity of the dimer remains controversial. The approximately 1000-fold difference between monomer-dimer equilibrium constant (microM) and receptor binding constant (nM) of IL-8 does not allow receptor-binding affinity measurements of the native IL-8 dimer. In this study, we overcame this roadblock by creating a "trapped" nondissociating dimer that contains a disulfide bond across the dimer interface at the 2-fold symmetry point. The NMR studies show that the structure of this trapped dimer is indistinguishable from the native dimer. The trapped dimer, compared to a trapped monomer, bound CXCR1 with approximately 70-fold and CXCR2 with approximately 20-fold lower affinities. Receptor binding involves two interactions, between the IL-8 N-loop and receptor N-domain residues, and between IL-8 N-terminal and receptor extracellular loop residues. In contrast to a trapped monomer that bound an isolated CXCR1 N-domain peptide with microM affinity, the trapped dimer failed to show any binding, indicating that dimerization predominantly perturbs the binding of only the N-loop residues. These results demonstrate that only the monomer is a high-affinity ligand for both receptors, and also provide a structural basis for the lower binding affinity of the dimer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».