Modeling the impact of novel diagnostic tests on pediatric and extrapulmonary tuberculosis
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Extrapulmonary tuberculosis (EPTB) and most pediatric TB cannot be diagnosed using sputum-based assays. The epidemiological impact of different strategies to diagnose EPTB and pediatric TB is unclear. METHODS: We developed a dynamic epidemic model of TB in a hypothetical population with epidemiological characteristics similar to India. We evaluated the impact of four alternative diagnostic test platforms on adult EPTB and pediatric TB mortality over 10 years: (1) Nucleic acid amplification test optimized for diagnosis of EPTB ("NAAT-EPTB"); (2) NAAT optimized for pediatric TB ("NAAT-Peds"); (3) more deployable NAAT for sputum-based diagnosis of adult pulmonary TB ("point-of-care (POC) sputum NAAT"); and (4) more deployable NAAT capable of diagnosing all forms of TB using non-invasive, non-sputum specimens ("POC non-sputum NAAT"). RESULTS: NAAT-EPTB lowered adult EPTB mortality by a projected 7.6% (95% uncertainty range [UR]: 6.5-8.8%). NAAT-Peds lowered pediatric TB mortality by 6.8% (UR: 4.9-8.4%). POC sputum NAAT, though only able to diagnose pulmonary TB, reduced projected pediatric TB deaths by 13.3% (UR: 4.6-15.7%) and adult EPTB deaths by 8.4% (UR 2.0-9.3%) simply by averting transmission of disease. POC non-sputum NAAT had the greatest effect, lowering pediatric TB mortality by 34.7% (UR: 26.8-38.7), and adult EPTB mortality by 38.5% (UR: 30.7-41.2). The relative impact of a POC sputum NAAT (i.e., enhanced deployability) versus NAAT-EPTB (i.e., enhanced ability to specifically diagnose TB-NSP) on adult EPTB mortality depends most strongly on factors that influence transmission, with settings of higher transmission (e.g., higher per-person transmission rate, lower diagnostic rate) favoring POC sputum NAAT. CONCLUSION: Although novel tests for pediatric TB and EPTB are likely to reduce TB mortality, major reductions in pediatric and EPTB incidence and mortality also require better diagnostic tests for adult pulmonary TB that reach a larger population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».