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Enregistrement W2163144047 · doi:10.1002/nbm.840

Toward dynamic isotopomer analysis in the rat brain <i>in vivo</i>: automatic quantitation of <sup>13</sup>C NMR spectra using LCModel

2003· article· en· W2163144047 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNMR in Biomedicine · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensOakville Public Library
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of MinnesotaW. M. Keck FoundationNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésIsotopomersIn vivoChemistryGlutamineNuclear magnetic resonanceNMR spectra databaseAnalytical Chemistry (journal)Spectral lineChromatographyBiochemistryAmino acidBiologyMoleculePhysicsGeneticsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The LCModel method was adapted to analyze localized in vivo (13)C NMR spectra obtained from the rat brain in vivo at 9.4 T. Prior knowledge of chemical-shifts, J-coupling constants and J-evolution was included in the analysis. Up to 50 different isotopomer signals corresponding to 10 metabolites were quantified simultaneously in 400 microl volumes in the rat brain in vivo during infusion of [1,6-(13)C(2)]glucose. The analysis remained accurate even at low signal-to-noise ratio of the order of 3:1. The relative distribution of isotopomers in glutamate, glutamine and aspartate determined in vivo in 22 min was in excellent agreement with that measured in brain extracts. Quantitation of time series of (13)C spectra yielded time courses of total (13)C label incorporation into up to 16 carbon positions, as well as time courses of individual isotopomer signals, with a temporal resolution as low as 5 min (dynamic isotopomer analysis). The possibility of measuring in vivo a wealth of information that was hitherto accessible only in extracts is likely to expand the scope of metabolic studies in the intact brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,853
Score d'incertitude au seuil0,596

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle