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Enregistrement W2163150133 · doi:10.1186/1471-2156-6-s1-s1

Genetic Analysis Workshop 14: microsatellite and single-nucleotide polymorphism marker loci for genome-wide scans

2005· article· en· W2163150133 sur OpenAlexaff
Joan E. Bailey‐Wilson, Laura Almasy, Mariza de Andrade, Julia N. Bailey, Heike Bickeböller, Heather J. Cordell, E. Warwick Daw, Lynn R. Goldin, Ellen L. Goode, Courtney Gray‐McGuire, Wayne A. Hening, Gail P. Jarvik, Brion S. Maher, Nancy R. Mendell, Andrew D. Paterson, John P. Rice, Glen A. Satten, Brian K. Suarez, Veronica J. Vieland, Marsha Wilcox, Heping Zhang, Andreas Ziegler, Jean W. MacCluer

Notice bibliographique

RevueBMC Genetics · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Human Genome Research InstituteNational Institute of Mental Health
Mots-clésMicrosatelliteSingle-nucleotide polymorphismGeneticsBiologyGenetic markerGenomeGenome ScanComputational biologyGenotypeAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Preface: This supplement to BMC Genetics contains the proceedings of the Genetic Analysis Workshop 14 (GAW14), which was held September 710, 2004, in Noordwijkerhout, The Netherlands. These workshops have been held since 1982 and now are held biennially. They serve as a forum for statisticians, epidemiologists, geneticists, and other scientists interested in these fields to introduce novel statistical methods and to evaluate and compare novel and existing methods. At each GAW, an existing dataset is selected, and a set of simulated data is devised such that statistical questions of wide and current interest may be addressed. These data are made available to scientists worldwide who then report the results of their analyses of these data at the GAW meeting. GAW attendees must submit an analysis of one of these datasets, or be a workshop organizer or a dataset provider. The purpose of these workshops is to allow the comparison of statistical methodologies for genetic epidemiology using the same, well-described datasets. More information about GAW, including details of upcoming workshops, may be found at http://www.gaworkshop.org. ...

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,130
Score d'incertitude au seuil0,434

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0050,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0060,003
Intégrité de la recherche0,0030,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1300,109

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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