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Enregistrement W2163229987 · doi:10.1139/bcb-2012-0103

Knockdown of prothymosin α leads to apoptosis and developmental defects in zebrafish embryos

2013· article· en· W2163229987 sur OpenAlexvenueno aff
Anastasia Emmanouilidou, Zoe Karetsou, Ellie Tzima, Takahiko Kobayashi, Thomais Papamarcaki

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundEuropean Commission
Mots-clésMorpholinoBiologyCell biologyZebrafishGene knockdownApoptosisProgrammed cell deathSmall hairpin RNAPopulationMolecular biologyImmunostainingImmunologyGeneticsImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prothymosin alpha (ProTα) is an abundant nuclear protein involved in cellular processes intricately linked to development, such as cell proliferation and apoptosis. Although it is known that ProTα inhibits the formation of apoptosome and blocks caspase-3 activity, its mechanism of function in the apoptotic machinery is still under investigation. We have studied the cellular role of ProTα by knocking down its expression in HeLa cells with small hairpin RNA (shRNA) in the absence of apoptotic stimuli. Flow cytometric analysis showed that the live cell population was significantly decreased with a concomitant increase of the apoptotic populations. To understand the physiological role of ProTα within the context of embryonic development, we knocked down the Ptmab zebrafish ortholog using 2 specific morpholino oligonucleotides. Ptmab morphants exhibited growth retardation, bended trunks, and curly tails. The frequency of occurrence of the phenotypic defects was increased in a morpholino dose-dependent manner. Co-injection of ptmaa mRNA with ptmab morpholino partially rescued the morphological defects. Immunostaining with the anti-phospho-histone H3 (pH3) antibody suggested that the abnormalities of Ptmab morphants could be due to defective cell proliferation that results in growth imbalances. TUNEL fluorescent labelling and Acridine Orange staining of the morphants showed high rates of cell death in the head and tail regions. Concomitantly, the active form of caspase-3 was detected in Ptmab morphants. Our data suggest a conserved anti-apoptotic role of ProTα between zebrafish and humans, and provide the first evidence that ProTα is important for early embryogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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