Characterization of a <i>Dehalobacter</i> Coculture That Dechlorinates 1,2-Dichloroethane to Ethene and Identification of the Putative Reductive Dehalogenase Gene
Notice bibliographique
Résumé
Dehalobacter and "Dehalococcoides" spp. were previously shown to be involved in the biotransformation of 1,1,2-trichloroethane (1,1,2-TCA) and 1,2-dichloroethane (1,2-DCA) to ethene in a mixed anaerobic enrichment culture. Here we report the further enrichment and characterization of a Dehalobacter sp. from this mixed culture in coculture with an Acetobacterium sp. Through a series of serial transfers and dilutions with acetate, H(2), and 1,2-DCA, a stable coculture of Acetobacterium and Dehalobacter spp. was obtained, where Dehalobacter grew during dechlorination. The isolated Acetobacterium strain did not dechlorinate 1,2-DCA. Quantitative PCR with specific primers showed that Dehalobacter cells did not grow in the absence of a chlorinated electron acceptor and that the growth yield with 1,2-DCA was 6.9 (+/-0.7) x 10(7) 16S rRNA gene copies/mumol 1,2-DCA degraded. PCR with degenerate primers targeting reductive dehalogenase genes detected three distinct Dehalobacter/Desulfitobacterium-type sequences in the mixed-parent culture, but only one of these was present in the 1,2-DCA-H(2) coculture. Reverse transcriptase PCR revealed the transcription of this dehalogenase gene specifically during the dechlorination of 1,2-DCA. The 1,2-DCA-H(2) coculture could dechlorinate 1,2-DCA but not 1,1,2-TCA, nor could it dechlorinate chlorinated ethenes. As a collective, the genus Dehalobacter has been show to dechlorinate many diverse compounds, but individual species seem to each have a narrow substrate range.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».