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Enregistrement W2163430049 · doi:10.1111/all.12003

The single nucleotide polymorphism <scp><i>CRTh2</i></scp> rs533116 is associated with allergic asthma and increased expression of <scp>CRT</scp>h2

2012· article· en· W2163430049 sur OpenAlexafffund
Eduardo Campos‐Alberto, E. MacLean, C. Davidson, Nami Shrestha Palikhe, Jessica Storie, Connie Tse, Darren M. Brenner, Irvin Mayers, Harissios Vliagoftis, Ahmed El‐Sohemy, Lisa Cameron

Notice bibliographique

RevueAllergy · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Alberta
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismImmunologyAllergic inflammationPopulationAllergyGenotypeAsthmaMedicineSNPMolecular biologyBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: CRTh2 (chemoattractant-receptor homologous molecule expressed on Th2 cells) is expressed by Th2 cells and other cells involved in allergic inflammation. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in CRTh2 (rs11571288, rs545659, rs634681) have been associated with various phenotypes of allergy in ethnically distinct populations. Here, we assessed the association between CRTh2 rs533116 and allergic asthma, expression of CRTh2 and Th2 cytokine production. METHODS: CRTh2 rs533116 was genotyped in an ethnically diverse population (n = 1282). The proportion of cells expressing CRTh2 was determined in peripheral blood from subjects with allergic airways disease and controls as well as with in vitro differentiated Th2 cells. Receptor function was assessed by stimulating Th2 cells with the CRTh2-specific agonist 13,14-dihydro-15-keto-PGD(2) (DK-PGD(2) ) and measuring IL-4 and IL-13 by intracellular staining and ELISA. RESULTS: CRTh2 rs533116 was associated with allergic asthma in White people (2.67 [1.09-6.55], P < 0.05), and expression of CRTh2 was higher in subjects with allergic airways disease compared to controls (P < 0.05). Among allergic individuals, the AA genotype was significantly associated with more eosinophils and higher expression of CRTh2 by both CD4(+) T cells and eosinophils (P < 0.05). In vitro, the AA genotype was associated with a higher proportion of CRTh2(+) cells during Th2 differentiation as well as more IL-4 and IL-13 expression following DK-PGD(2) stimulation (P < 0.05). CONCLUSIONS: These findings show an association between CRTh2 rs533116 and allergic asthma and suggest this may be mediated by elevated expression of CRTh2, leading to higher numbers of circulating eosinophils and Th2 cytokine production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,496
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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