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Enregistrement W2163504716 · doi:10.1083/jcb.200509124

Coupling of the nucleus and cytoplasm: Role of the LINC complex

2005· article· en· W2163504716 sur OpenAlexaff
Melissa Crisp, Qian Liu, Kyle J. Roux, J. B. Rattner, Catherine M. Shanahan, Brian Burke, Phillip D. Stahl, Didier Hodzic

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Cell Biology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCytoplasmInner membraneBiologyNucleusEndoplasmic reticulumCell biologyCytoskeletonNuclear poreMembrane proteinBiophysicsCoupling (piping)MembraneCellBiochemistryMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nuclear envelope defines the barrier between the nucleus and cytoplasm and features inner and outer membranes separated by a perinuclear space (PNS). The inner nuclear membrane contains specific integral proteins that include Sun1 and Sun2. Although the outer nuclear membrane (ONM) is continuous with the endoplasmic reticulum, it is nevertheless enriched in several integral membrane proteins, including nesprin 2 Giant (nesp2G), an 800-kD protein featuring an NH(2)-terminal actin-binding domain. A recent study (Padmakumar, V.C., T. Libotte, W. Lu, H. Zaim, S. Abraham, A.A. Noegel, J. Gotzmann, R. Foisner, and I. Karakesisoglou. 2005. J. Cell Sci. 118:3419-3430) has shown that localization of nesp2G to the ONM is dependent upon an interaction with Sun1. In this study, we confirm and extend these results by demonstrating that both Sun1 and Sun2 contribute to nesp2G localization. Codepletion of both of these proteins in HeLa cells leads to the loss of ONM-associated nesp2G, as does overexpression of the Sun1 lumenal domain. Both treatments result in the expansion of the PNS. These data, together with those of Padmakumar et al. (2005), support a model in which Sun proteins tether nesprins in the ONM via interactions spanning the PNS. In this way, Sun proteins and nesprins form a complex that links the nucleoskeleton and cytoskeleton (the LINC complex).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 359
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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