The maize ID1 flowering time regulator is a zinc finger protein with novel DNA binding properties
Notice bibliographique
Résumé
The INDETERMINATE protein, ID1, plays a key role in regulating the transition to flowering in maize. ID1 is the founding member of a plant-specific zinc finger protein family that is defined by a highly conserved amino sequence called the ID domain. The ID domain includes a cluster of three different types of zinc fingers separated from a fourth C2H2 finger by a long spacer; ID1 is distinct from other ID domain proteins by having a much longer spacer. In vitro DNA selection and amplification binding assays and DNA binding experiments showed that ID1 binds selectively to an 11 bp consensus motif via the ID domain. Unexpectedly, site-directed mutagenesis of the ID1 protein showed that zinc fingers located at each end of the ID domain are not required for binding to the consensus motif despite the fact that one of these zinc fingers is a canonical C2H2 DNA binding domain. In addition, an ID1 in vitro deletion mutant that lacks the extra spacer between zinc fingers binds the same 11 bp motif as normal ID1, suggesting that all ID domain-containing proteins recognize the same DNA target sequence. Our results demonstrate that maize ID1 and ID domain proteins have novel zinc finger configurations with unique DNA binding properties.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».