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Enregistrement W2163836090 · doi:10.1073/pnas.1015125108

Auto-inhibitory role of the EF-SAM domain of STIM proteins in store-operated calcium entry

2011· article· en· W2163836090 sur OpenAlexafffund
Le Zheng, Peter B. Stathopulos, Rainer Schindl, Guangyao Li, Christoph Romanin, Mitsuhiko Ikura

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueIon Channels and Receptors
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSTIM1Endoplasmic reticulumGene isoformCell biologyEF handBiophysicsChemistryCalciumContext (archaeology)Calcium-binding proteinBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stromal interaction molecules (STIM)s function as endoplasmic reticulum calcium (Ca(2+)) sensors that differentially regulate plasma membrane Ca(2+) release activated Ca(2+) channels in various cells. To probe the structural basis for the functional differences between STIM1 and STIM2 we engineered a series of EF-hand and sterile α motif (SAM) domain (EF-SAM) chimeras, demonstrating that the STIM1 Ca(2+)-binding EF-hand and the STIM2 SAM domain are major contributors to the autoinhibition of oligomerization in each respective isoform. Our nuclear magnetic resonance (NMR) derived STIM2 EF-SAM structure provides a rationale for an augmented stability, which involves a 54° pivot in the EF-hand:SAM domain orientation permissible by an expanded nonpolar cleft, ionic interactions, and an enhanced hydrophobic SAM core, unique to STIM2. Live cells expressing "super-unstable" or "super-stable" STIM1/STIM2 EF-SAM chimeras in the full-length context show a remarkable correlation with the in vitro data. Together, our data suggest that divergent Ca(2+)- and SAM-dependent stabilization of the EF-SAM fold contributes to the disparate regulation of store-operated Ca(2+) entry by STIM1 and STIM2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations138
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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