X-Chromosome Inactivation in Rett Syndrome Human Induced Pluripotent Stem Cells
Notice bibliographique
Résumé
Rett syndrome (RTT) is a neurodevelopmental disorder that affects girls due primarily to heterozygous mutations in the X-linked gene encoding methyl-CpG binding protein 2 (MECP2). Random X-chromosome inactivation (XCI) results in cellular mosaicism in which some cells express wild-type (WT) MECP2 while other cells express mutant MECP2. The generation of patient-specific human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) facilitates the production of RTT-hiPSC-derived neurons in vitro to investigate disease mechanisms and identify novel drug treatments. The generation of RTT-hiPSCs has been reported by many laboratories, however, the XCI status of RTT-hiPSCs has been inconsistent. Some report RTT-hiPSCs retain the inactive X-chromosome (post-XCI) of the founder somatic cell allowing isogenic RTT-hiPSCs that express only the WT or mutant MECP2 allele to be isolated from the same patient. Post-XCI RTT-hiPSCs-derived neurons retain this allele-specific expression pattern of WT or mutant MECP2. Conversely, others report RTT-hiPSCs in which the inactive X-chromosome of the founder somatic cell reactivates (pre-XCI) upon reprogramming into RTT-hiPSCs. Pre-XCI RTT-hiPSC-derived neurons exhibit random XCI resulting in cellular mosaicism with respect to WT and mutant MECP2 expression. Here we review and attempt to interpret the inconsistencies in XCI status of RTT-hiPSCs generated to date by comparison to other pluripotent systems in vitro and in vivo and the methods used to analyze XCI. Finally, we discuss the relative strengths and weaknesses of post- and pre-XCI hiPSCs in the context of RTT, and other X-linked and autosomal disorders for translational medicine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».