Monocyte lipid rafts contain proteins implicated in vesicular trafficking and phagosome formation
Notice bibliographique
Résumé
Lipid rafts are membrane microdomains of unique lipid composition that segregate proteins with poorly understood consequences for membrane organization. Identification of raft associated proteins could therefore provide novel insight into raft-dependent functions. Monocytes process antigens for presentation to T cells by ingesting pathogens into calcium-dependent plasma membrane invaginations called "phagosomes" which develop by sequential fusion with the endoplasmic reticulum, early and late endosomes. We investigated the protein composition of Triton X-100 insoluble low density membranes of the monocyte cell-line THP-1 by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight and tandem mass spectrometry. The ganglioside GM1 colocalized on the plasma membrane with the raft markers flotillin 1 and 2, which were enriched in low buoyant density fractions containing 52 identifiable proteins, 28 of which have not been reported in rafts, and nine of which are associated with the endoplasmic reticulum (ER). Remarkably, 27 of the 52 proteins are components of phagosomes, including the ER protein calnexin which we demonstrate is phosphorylated on serine 562, a switch controlling calcium homeostasis. The presence of the early and late endosome trafficking proteins Rab-1, and Rab-7 together with the late endosome protein LIMPII, indicate lipid rafts are present throughout endosome maturation. Identification of vacuolar ATP synthase, and synaptosomal-associated protein-23, proteins implicated in membrane fusion, together with the cytoskeletal proteins actin, alpha-actinin, and vimentin, and Rac 1, 2, and 3, regulators of cytoskeletal assembly, indicate monocyte lipid rafts contain the machinery to direct vesicular fusion and actin based vesicular migration throughout phagosome development.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».