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Enregistrement W2164013321 · doi:10.1093/glycob/cwn117

Complete chemoenzymatic synthesis of the Forssman antigen using novel glycosyltransferases identified in Campylobacter jejuni and Pasteurella multocida

2008· article· en· W2164013321 sur OpenAlexaff
R. Scott Houliston, Stéphane Bernatchez, Marie-France Karwaski, Robert E. Mandrell, Harold C. Jarrell, Warren W. Wakarchuk, Michel Gilbert

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensInstitute for Biological SciencesNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniGlycosyltransferasePasteurella multocidaGlycolipidGalactosyltransferaseMicrobiologyAntigenBiologyEscherichia coliGeneEnzymeBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have identified an alpha1,4-galactosyltransferase (CgtD) and a beta1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase (CgtE) in the lipooligosaccharide (LOS) locus of Campylobacter jejuni LIO87. Strains that carry these genes may have the capability of synthesizing mimics of the P blood group antigens of the globoseries glycolipids. We have also identified an alpha1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase (Pm1138) from Pasteurella multocida Pm70, which is involved in the synthesis of an LOS-bound Forssman antigen mimic and represents the only known bacterial glycosyltransferase with this specificity. The genes encoding the three enzymes were cloned and expressed in Escherichia coli as soluble recombinant proteins that can be used to chemoenzymatically synthesize the Forssman antigen, and its biosynthetic precursors, in high yields.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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