MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2164037382 · doi:10.5402/2012/153971

An Assessment of Epithelial and Mesenchymal Phenotypes in Experimental and Clinical Pulmonary Fibrosis

2012· article· en· W2164037382 sur OpenAlexaff
Rebecca Dunmore, Alan Carruthers, Matthew J. Bell, Huilan Zhang, Cory M. Hogaboam, Xueyang Peng, Erica L. Herzog, Darryl A. Knight, Fernando J. Martínez, Matthew A. Sleeman, Lynne A. Murray

Notice bibliographique

RevueISRN Pulmonology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary Fibrosis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMesenchymal stem cellIdiopathic pulmonary fibrosisEpithelial–mesenchymal transitionPathologyBleomycinPulmonary fibrosisFibrosisPhenotypeCancer researchLungMedicineBiologyInternal medicineCancerGeneMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epithelial injury has been implicated as a driving factor for the pathogenesis of idiopathic pulmonary fibrosis (IPF). In this study we investigated changes in epithelial and mesenchymal markers in experimental models of fibrosis and associated this with IPF. TGFβ1induced an epithelial to mesenchymal transition (EMT) phenotype in A549 cells and normal human bronchial epithelial cells, with A549 cells exhibiting a more profound transition to a mesenchymal phenotype. TGFβ1overexpression in the lungs of mice resulted in an early increase in mesenchymal cell markers and apoptotic genes that preceded collagen deposition, suggesting an early epithelial injury triggers the downstream fibrotic response. In contrast, bleomycin had a gradual increase in mesenchymal cell marker and a decrease in E-cadherin expression that correlated with collagen protein deposition. Finally, we compared normal healthy lung tissue with surgical lung biopsies from IPF patients and observed alterations in epithelial and mesenchymal cell markers, as well as an increase in the apoptotic marker GSK3β. Interestingly, the mesenchymal changes were more profound in rapidly progressive patients in comparison to IPF patients with slowing progressing disease. In summary, this study provides evidence of alterations in epithelial and mesenchymal markers in experimental models of lung fibrosis and how these findings are relevant to clinical disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueISRN PulmonologyMême sujetInterstitial Lung Diseases and Idiopathic Pulmonary FibrosisTravaux en français237 207