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Enregistrement W2164041929 · doi:10.1111/j.1365-2958.2007.06010.x

Integration of two essential virulence modulating signals at the<i>Erwinia chrysanthemi pel</i>gene promoters: a role for Fis in the growth‐phase regulation

2007· article· en· W2164041929 sur OpenAlexaff
Thomas Lautier, Nicolas Blot, Georgi Muskhelishvili, William Nasser

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensCanadian Nautical Research Society
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche Scientifique
Mots-clésBiologyVirulencePromoterGeneErwiniaMicrobiologyGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Production of the essential virulence factors, called pectate lyases (Pels), in the phytopathogenic bacterium Erwinia chrysanthemi is controlled by a complex regulation system and responds to various stimuli, such as the presence of pectin or plant extracts, growth phase, temperature and iron concentration. The presence of pectin and growth phase are the most important signals identified. Eight regulators modulating the expression of the pel genes (encoding Pels) have been characterized. These regulators are organized in a network allowing a sequential functioning of the regulators during infection. Although many studies have been carried out, the mechanisms of control of Pel production by growth phase have not yet been elucidated. Here we report that a fis mutant of E. chrysanthemi showed a strong increase in transcription of the pel genes during exponential growth whereas induction of expression in the parental strain occurred at the end of exponential growth. This reveals that Fis acts to prevent an efficient transcription of pel genes at the beginning of exponential growth and also provides evidence of the involvement of Fis in the growth-phase regulation of the pel genes. By using in vitro DNA-protein interactions and transcription experiments, we find that Fis directly represses the pel gene expression at the transcription initiation step. In addition, we show that Fis acts in concert with KdgR, the main repressor responding to the presence of pectin compounds, to shut down the pel gene transcription. Finally, we find that active Fis is required for the efficient translocation of the Pels in growth medium. Together, these data indicate that Fis tightly controls the availability of Pels during pathogenesis by acting on both their production and their translocation in the external medium.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,041
Score d'incertitude au seuil0,366

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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