MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2164098358 · doi:10.1104/pp.110.162883

Two Oxidosqualene Cyclases Responsible for Biosynthesis of Tomato Fruit Cuticular Triterpenoids   

2010· article· en· W2164098358 sur OpenAlexafffund
Zhonghua Wang, Ortwin Guhling, Ruonan Yao, Fengling Li, Trevor H. Yeats, Jocelyn K. C. Rose, Reinhard Jetter

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesBritish Columbia Knowledge Development FundNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésSolanumEnzymeBiochemistryBiosynthesisBiologyTerpenoidChemistryBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The first committed step in triterpenoid biosynthesis is the cyclization of epoxysqualene into various triterpene alcohol isomers, a reaction catalyzed by oxidosqualene cyclases (OSCs). The different OSCs have characteristic product specificities, which are mainly due to differences in the numbers of high-energy intermediates the enzymes can stabilize. The goal of this investigation was to clone and characterize OSCs from tomato (Solanum lycopersicum), a species known to accumulate δ-amyrin in its fruit cuticular wax, in order to gain insights into the enzymatic formation of this particular triterpenoid. We used a homology-based approach to isolate two tomato OSCs and tested their biochemical properties by heterologous expression in yeast as well as overexpression in tomato. One of the enzymes was found to be a product-specific β-amyrin synthase, while the other one was a multifunctional OSC synthesizing 48% δ-amyrin and six other products. The product spectra of both OSCs together account for both the range and the relative amounts of the triterpenoids found in the fruit cuticle. Both enzymes were expressed exclusively in the epidermis of the tomato fruit, indicating that their major function is to form the cuticular triterpenoids. The relative expression levels of both OSC genes, determined by quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction, were consistent with product profiles in fruit and leaves of the tomato cultivar MicroTom. However, the transcript ratios were only partially consistent with the differences in amounts of product triterpenoids between the tomato cultivars MicroTom, M82, and Ailsa Craig; thus, transcriptional control of the two OSCs alone cannot explain the fruit triterpenoid profiles of the cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,849

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations122
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLANT PHYSIOLOGYMême sujetPlant biochemistry and biosynthesisTravaux en français237 207