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Enregistrement W2164104132 · doi:10.1046/j.1471-4159.2003.01670.x

Protein kinase and protein phosphatase expression in amyotrophic lateral sclerosis spinal cord

2003· article· en· W2164104132 sur OpenAlexafffund
Jie Hu, H. Zhang, R. Wagey, Charles Krieger, Steven Pelech

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurochemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaKinexus Bioinformatics Corporation (Canada)Simon Fraser University
Organismes subventionnairesMuscular Dystrophy CanadaALS Society of CanadaMuscular Dystrophy Association
Mots-clésProtein kinase RProtein kinase AProtein kinase CKinaseMitogen-activated protein kinase kinaseP70-S6 Kinase 1PhosphataseCyclin-dependent kinase 2cGMP-dependent protein kinaseBiologyASK1Myelin basic proteinRibosomal protein s6EndocrinologyMAP2K7Molecular biologyChemistryPhosphorylationProtein phosphorylationBiochemistryProtein kinase BMyelinCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Kinetworks trade mark multi-immunoblotting technique was used to evaluate the expressions of 78 protein kinases, 24 protein phosphatases and phosphorylation states of 31 phosphoproteins in thoracic spinal cord tissue from control subjects and patients having the sporadic form of amyotrophic lateral sclerosis (ALS). In both the cytosolic (C) and particulate (P) fractions of spinal cord from ALS patients as compared with controls, there were increased levels of calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase (CaMKK; C = 120% increase/P = 580% increase;% change, compared with control), extracellular regulated kinase 2 (ERK2; C = 120% increase/P = 170% increase), G protein-coupled receptor kinase 2 (GRK2; C = 140% increase/P = 140% increase), phospho-Y279/216 glycogen synthase kinase 3 alpha/beta (GSK3alpha/beta; C = 90% increase/P = 220% increase), protein kinase B alpha (PKBalpha; C = 360% increase/P = 200% increase), phospho-T638 PKCalpha/beta (C = 630% increase/P = 170% increase), cGMP-dependent protein kinase (PKG; C = 100% increase/P = 75% increase), phospho-T451 dsRNA-dependent protein kinase (PKR; C = 2600% increase/P = 3330% increase), ribosomal S6 kinase 1 (RSK1; C = 750% increase/P = 630% increase), phospho-T389 p70 S6 kinase (S6K; C = 1000% increase/P = 460% increase), and protein-tyrosine phosphatase 1 delta (PTP1delta; C = 43% increase/P = 70% increase). Cytosolic increases in phospho-alpha-S724/gamma-S662 adducin (C = 15650% increase), PKCalpha (C = 100% increase) and PKCzeta (C = 190% increase) were found in ALS patients as compared with controls, while particulate increases in cAMP-dependent protein kinase (PKA; 43% increase), protein kinase C beta (PKCbeta; 330% increase), and stress-activated protein kinase beta (SAPKbeta; 34% increase) were also observed. Cyclin-dependent kinase-associated phosphatase (KAP) was apparently translocated, as it was reduced (31% decrease) in cytosolic fractions but elevated (100% increase) in particulate fractions of ALS spinal cord tissue. Our observations indicate that ALS is associated with the elevated expression and/or activation of many protein kinases, including PKCalpha, PKCbeta, PKCzeta and GSK3alpha/beta, which may augment neural death in ALS, and CaMKK, PKBalpha, Rsk1, S6K, and SAPK, which may be a response to neuronal injury that potentially can mitigate cell death.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations164
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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