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Enregistrement W2164114621 · doi:10.1152/ajpgi.00128.2007

Involvement of Sp1 and Sp3 in differential regulation of human NHE3 promoter activity by sodium butyrate and IFN-γ/TNF-α

2007· article· en· W2164114621 sur OpenAlexfundno aff
Md Ruhul Amin, Pradeep K. Dudeja, Krishnamurthy Ramaswamy, Jaleh Malakooti

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Gastrointestinal and Liver Physiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSodium butyrateMolecular biologyGene knockdownButyratePromoterTransfectionChemistryWestern blotSp1 transcription factorGene expressionSmall interfering RNATumor necrosis factor alphaBiologyApoptosisGeneBiochemistryEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previously, we reported that IFN-gamma and TNF-alpha downregulate the expression of the human Na(+)/H(+) exchanger (NHE)3 gene by modulating Sp1/Sp3 transcription factors in C2BBe1 cells. It is reported that butyrate inhibits IFN-gamma and TNF-alpha signaling pathways. In this study, we have investigated the effect of sodium butyrate (NaB) and IFN-gamma/TNF-alpha on human NHE3 promoter activity. In transient transfection studies, NaB (5 mM) led to 10-fold stimulation of NHE3 promoter activity after incubation for 24 h. With 5'-deletion analysis, the NaB-responsive region was mapped to the NHE3 core promoter, bp -95 to + 5, which we had shown previously to confer responsiveness to IFN-gamma/TNF-alpha. The stimulatory effect of NaB on the NHE3 promoter was reduced by 60% in the presence of IFN-gamma/TNF-alpha. Mutually, the repressive effect of these cytokines was attenuated by NaB. Knockdown of Sp1 and Sp3 expression with small interfering RNA (siRNA) resulted in a significant resistance to NaB effects. NaB treatment showed no effect on Sp1 and Sp3 protein expression as assessed by Western blot analyses. Gel mobility shift assays with nuclear proteins from NaB-treated cells showed enhanced binding of Sp1 and Sp3 to the NHE3 promoter. The phosphatase inhibitor okadaic acid (200 nM) blocked the stimulatory effect of NaB on the NHE3 promoter. NaB effects on the NHE3 promoter were significantly attenuated by protein phosphatase (PP)1alpha- and PP2Aalpha-specific siRNA transfection. Our data suggest that the differential regulation of NHE3 gene expression by NaB and IFN-gamma/TNF-alpha is mediated through alternative pathways that converge on Sp1/Sp3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,690
Score d'incertitude au seuil0,531

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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