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Enregistrement W2164122217 · doi:10.1002/jat.1369

Application of structure–activity relationships to investigate the molecular mechanisms of hepatocyte toxicity and electrophilic reactivity of <i>α</i>,<i>β</i>‐unsaturated aldehydes

2008· article· en· W2164122217 sur OpenAlexaff
Katie Chan, Raymond Poon, Peter J. O’Brien

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Toxicology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical Acid Research Studies
Établissements canadiensHealth CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElectrophileNucleophileChemistryReactivity (psychology)HepatocyteAmine gas treatingToxicityStereochemistryBiochemistryOrganic chemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Covalent binding of reactive electrophiles to cellular targets is a molecular interaction that has the potential to initiate severe adverse biological effects. Therefore, a measure for electrophilic reactivity with biological nucleophiles could serve as an important correlate to toxic effects such as hepatocyte death. To determine if electrophile reactivity correlates with rat hepatocyte cytotoxicity, the inherently electrophilic alpha,beta-unsaturated aldehydes were chosen for investigation. Reactivity was measured with simple assays that used glutathione, a soft nucleophile, and butylamine, a harder nucleophile, as models for protein thiol and amine nucleophilic sites, respectively. Despite their higher reactivity with thiols, a linear relationship was only observed between hepatocyte cytotoxicity and amine reactivity. Structure-activity relationships were also investigated for hepatocyte toxicity, and results showed toxicity was well modelled by log P and electronic parameters E(LUMO) and partial charge of the carbonyl carbon (C'(carb)). Hydrophobicity and electronic descriptors were only significant in separate distinct models, suggesting that there were simultaneously occurring mechanisms that affected toxicity. Log P was linked to the ease of oxidation by a microsomal aldehyde dehydrogenase enzyme, while the electronic descriptors and amine reactivity were linked to direct alkylation. Even with the presence of electrophile characteristics, alpha,beta-unsaturated aldehyde hepatocyte toxicity could not be predicted exclusively by electrophilic reactivity as oxidative metabolism was also a factor for toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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