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Enregistrement W2164188008 · doi:10.1111/j.1365-313x.2007.03056.x

Structural analogs of ABA reveal novel features of ABA perception and signaling in Arabidopsis

2007· article· en· W2164188008 sur OpenAlexafffund
Daiqing Huang, Masrur R Jaradat, Weiren Wu, Stephen J. Ambrose, Andrew R. S. Ross, Suzanne R. Abrams, Adrian J. Cutler

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensPlant Biotechnology Institute
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaGenome PrairieUniversity of AlbertaMinistry of Agriculture - SaskatchewanGenome Canada
Mots-clésAbscisic acidArabidopsisGeneMutantArabidopsis thalianaGene expressionBiologyPlant hormoneCell biologyBiochemistryChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Changes in gene expression produced by the application of (+)-abscisic acid (ABA) to Arabidopsis thaliana plants were compared with changes produced by the ABA structural analogs (-)-ABA, (+)-8'-acetylene ABA and (-)-2',3'-dihydroacetylenic abscisyl alcohol. The maximum expression of many rapidly (+)-ABA-induced genes occurred prior to peak hormone accumulation, suggesting negative feedback regulation that may be mediated by the induction of genes encoding PP2C-type protein phosphatases. For most rapidly (+)-ABA-induced genes, expression was delayed in ABA analog treatments although analogs accumulated to higher levels than did (+)-ABA. For each analog, some genes exhibited a hypersensitive response to the analog and some genes were less sensitive to the analog than to (+)-ABA. Variations in the sensitivity of gene expression to (+)-ABA and analogs reflect the different structural requirements of two or more classes of hormone receptors. By using ABA analogs to reveal and confirm weakly (+)-ABA-regulated genes, we estimate that 14% of Arabidopsis genes are ABA-regulated in aerial tissues. Treatments with the analog (+)-8'-acetylene ABA (PBI425) led to the identification of new ABA-regulated genes. As an example, the transcription factor MYBR1 was significantly induced by PBI425, but not by (+)-ABA, and is shown to play a role in ABA signaling by phenotypic analysis of gain-of-function and loss-of-function mutants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations101
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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