MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2164259062 · doi:10.1186/1866-1955-6-1

Associations of HLA alleles with specific language impairment

2014· article· en· W2164259062 sur OpenAlexfundno aff
Ron Nudel, Nuala H. Simpson, Gillian Baird, Anne O’Hare, Gina Conti‐Ramsden, Patrick Bolton, Elizabeth R Hennessy, Anthony P. Monaco, Julian C. Knight, Bruce Winney, Simon E. Fisher, Dianne F. Newbury

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurodevelopmental Disorders · 2014
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueLanguage Development and Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean CommissionUniversity of OxfordMax-Planck-GesellschaftUniversity of AberdeenKing's College LondonSt. John's College, University of OxfordHospital for Sick ChildrenWellcome TrustNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research CouncilQueen Margaret University
Mots-clésHuman leukocyte antigenSpecific language impairmentAlleleSingle-nucleotide polymorphismGenetic associationGeneticsPsychologyPopulationGenome-wide association studyAssociation (psychology)BiologyDevelopmental psychologyMedicineGenotypeGeneAntigen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human leukocyte antigen (HLA) loci have been implicated in several neurodevelopmental disorders in which language is affected. However, to date, no studies have investigated the possible involvement of HLA loci in specific language impairment (SLI), a disorder that is defined primarily upon unexpected language impairment. We report association analyses of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and HLA types in a cohort of individuals affected by language impairment. METHODS: We perform quantitative association analyses of three linguistic measures and case-control association analyses using both SNP data and imputed HLA types. RESULTS: Quantitative association analyses of imputed HLA types suggested a role for the HLA-A locus in susceptibility to SLI. HLA-A A1 was associated with a measure of short-term memory (P = 0.004) and A3 with expressive language ability (P = 0.006). Parent-of-origin effects were found between HLA-B B8 and HLA-DQA1*0501 and receptive language. These alleles have a negative correlation with receptive language ability when inherited from the mother (P = 0.021, P = 0.034, respectively) but are positively correlated with the same trait when paternally inherited (P = 0.013, P = 0.029, respectively). Finally, case control analyses using imputed HLA types indicated that the DR10 allele of HLA-DRB1 was more frequent in individuals with SLI than population controls (P = 0.004, relative risk = 2.575), as has been reported for individuals with attention deficit hyperactivity disorder (ADHD). CONCLUSION: These preliminary data provide an intriguing link to those described by previous studies of other neurodevelopmental disorders and suggest a possible role for HLA loci in language disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Neurodevelopmental DisordersMême sujetLanguage Development and DisordersTravaux en français237 207