MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2164263837 · doi:10.1681/asn.2004080715

Heterogenous Nuclear Ribonucleoprotein F Modulates Angiotensinogen Gene Expression in Rat Kidney Proximal Tubular Cells

2005· article· en· W2164263837 sur OpenAlexaff
Chih‐Chang Wei, Deng‐Fu Guo, Shaoling Zhang, Julie R. Ingelfinger, John S.D. Chan

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Society of Nephrology · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensHôtel-Dieu de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood Institute
Mots-clésMolecular biologyHeterogeneous nuclear ribonucleoproteinHeterogeneous ribonucleoprotein particleRibonucleoproteinBiologyGene expressionNuclear proteinComplementary DNAMessenger RNARNA-binding proteinRNAGeneTranscription factorBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An insulin-responsive element (IRE) in the rat angiotensinogen (ANG) gene promoter that binds to two nuclear proteins with apparent molecular weights of 48 and 70 kD was identified previously from rat immortalized renal proximal tubular cells (IRPTC). The present studies aimed to identify and clone the 48-kD nuclear protein and to define its action on ANG gene expression. Nuclear proteins were isolated from IRPTC and subjected to two-dimensional electrophoresis. The 48-kD nuclear protein was detected by Southwestern blotting and subsequently identified by mass spectrometry, revealing that it was identical to 46-kD heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F (hnRNP F), a nuclear protein that binds to TATA-binding protein and associates with RNA polymerase II and also interacts with nuclear cap-binding complex. The hnRNP F cDNA was cloned from IRPTC by reverse transcriptase-PCR. Bacterially expressed recombinant hnRNP F bound to the rat ANG-IRE, as revealed by gel mobility shift assay. The addition of polyclonal antibodies against hnRNP F yielded a supershift in gel mobility. Transient transfer of sense and antisense hnRNP F cDNA in IRPTC inhibited and enhanced ANG gene expression, respectively. High glucose stimulated and insulin inhibited hnRNP F expression in IRPTC. Expression studies indicated that hnRNP F is present in the kidney, testis, liver, lung, and brain but not in the spleen. In conclusion, these studies demonstrate that hnRNP F binds to rANG-IRE and modulates renal ANG gene expression, implicating that dysregulation of hnRNP F might affect renin-angiotensin system activation and, subsequently, kidney injury in diabetes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Society of NephrologyMême sujetRNA Research and SplicingTravaux en français237 207