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Enregistrement W2164266966 · doi:10.3852/12-137

<i>Phialemoniopsis</i> , a new genus of Sordariomycetes, and new species of <i>Phialemonium</i> and <i>Lecythophora</i>

2013· article· ru· W2164266966 sur OpenAlexaff
Haybrig Perdomo, Dania García, Josepa Gené, J. Cano, Deanna A. Sutton, Richard C. Summerbell, Josep Guarro

Notice bibliographique

RevueMycologia · 2013
Typearticle
Langueru
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyIncertae sedisMonophylyInternal transcribed spacerBotanyPhylogenetic treeGenusTaxonomy (biology)Type speciesTaxonZoologyCladeGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In molecular studies involving numerous clinical isolates of the genera Acremonium, Phialemonium and Lecytophora some of them could not be identified. To clarify the phylogenetic relationships among these fungi and other related taxa, we performed a polyphasic study based on a detailed morphological study and on the analysis of sequences of four loci: the internal transcribed spacer regions, the D1/D2 domains of the 28S rRNA, actin and β-tubulin genes. The combination of the resulting data let us propose the new genus Phialemoniopsis to accommodate the opportunistic fungi Phialemonium curvatum and Sarcopodium oculorum and two new species, Phialemoniopsis cornearis and Phialemoniopsis pluriloculosa. The taxonomy of Phialemoniopsis has not been completely resolved, however, remaining incertae sedis within the Sordariomycetes. In addition, the new species Lecythophora luteorubra, Lecythophora cateniformis and Phialemonium globosum are described and the species Acremonium atrogriseum and Taifanglania inflata are transferred to the genus Phialemonium. Lecythophora and Phialemonium are currently monophyletic genera of the families Coniochaetaceae (Coniochaetales) and Cephalothecaceae (Sordariales) respectively, according to our results. Tables summarizing key morphological features to distinguish the current species of Lecythophora, Phialemonium and Phialemoniopsis are provided.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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