The Structure of the Protonated Adenine Dimer by Infrared Multiple Photon Dissociation Spectroscopy and Electronic Structure Calculations
Notice bibliographique
Résumé
The infrared multiple photon dissociation (IRMPD) spectrum of electrosprayed adenine proton-bound dimers were recorded in the gas-phase inside the cell of a Fourier transform ion cyclotron resonance spectrometer coupled to a tunable optical parametric oscillator/amplifier infrared laser. While gas-phase B3LYP/6-31+G(d,p) calculations indicate that the four lowest isomers are essentially isoenergetic, comparisons of the experimental and predicted IR spectra suggest that only two of the four isomers are observed in the experiment. However, computed solvation effects, as modeled using both a polarizable continuum model and microsolvation with five explicit water molecules, preferentially stabilize these two observed isomers, consistent with the interpretation of the IRMPD spectra. This work shows that for these small species the solvent-phase structure is preserved. It also demonstrates the potential danger of using gas-phase calculations to predict the structures of gaseous ions born in solution, such as those from an electrospray source.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».