A marine fish follows Wallace's Line: the phylogeography of the three‐spot seahorse (<i>Hippocampus trimaculatus</i>, Syngnathidae, Teleostei) in Southeast Asia
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Aim To test the potential of two contrasting biogeographical hypotheses (‘Indian/Pacific Ocean Basin’ vs. ‘Wallace's Line’) to explain the distribution of genetic diversity among populations of a marine fish in Southeast Asia. Location The marine waters of Asia and Southeast Asia: from India to Japan, and east to the Indonesian islands of Sulawesi and Flores. Methods We sequenced a 696 base pair fragment of cytochrome b DNA of 100 individuals of Hippocampus trimaculatus Leach 1814 (three‐spot seahorse), obtained from across its range. We tested our hypotheses using phylogenetic reconstructions and analyses of molecular variance. Results Significant genetic divergence was observed among the specimens. Two distinct lineages emerged that diverged by an average of 2.9%. The genetic split was geographically associated, but surprisingly it indicated a major east–west division similar to the terrestrial Wallace's Line (ΦST = 0.662, P < 0.001) rather than one consistent with an Indian‐Pacific ocean basin separation hypothesis (ΦST = 0.023, P = 0.153). Samples from east of Wallace's Line, when analysed separately, however, were consistent with an Indian/Pacific Ocean separation (ΦST = 0.461, P = 0.005). The degree of genetic and geographical structure within each lineage also varied. Lineage A, to the west, was evolutionarily shallow (star‐like), and the haplotypes it contained often occurred over a wide area. Lineage B to the east had greater genetic structure, and there was also some evidence of geographical localization of sublineages within B. Main conclusions Our results indicate that the genetic diversity of marine organisms in Southeast Asia may reflect a more complex history than the simple division between two major ocean basins that has been proposed by previous authors. In particular, the east–west genetic division observed here is novel among marine organisms examined to date. The high haplotype, but low nucleotide diversity to the west of Wallace's Line is consistent with post‐glacial colonization of the Sunda Shelf. Additional data are needed to test the generality of these patterns.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».