Differential utilization of NF-kappaB RELA and RELB in response to extracellular versus intracellular polyIC stimulation in HT1080 cells
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Pattern recognition receptors (PRRs) for double-stranded RNA (dsRNA) are components of innate immunity that recognize the presence of viral infection and initiate efficient defense mechanisms. In addition to previously well-characterized signaling pathways that are mediated by PKR and TLR3, new intracellular dsRNA sensors, that are members of CARD and DExD/H box helicase family, have been identified. However, the molecular mechanisms involved in the signaling pathways mediated by these new dsRNA sensors have not been extensively characterized. RESULTS: Here, we studied an intracellular dsRNA pathway in the human fibrosarcoma cell line HT1080, which is distinct from the TLR3-mediated extracellular dsRNA pathway. Particularly, the NF-kB subunits RELA and RELB were differentially utilized by these two dsRNA signaling pathways. In TLR3-mediated dsRNA signaling, siRNA knock-down studies suggested a limited role for RELA on regulation of interferon beta and other cytokines whereas RELB appeared to have a negative regulatory role. By contrast, intracellular dsRNA signaling was dependent on RELA, but not RELB. CONCLUSIONS: Our study suggests that extracellular and intracellular dsRNA signaling pathways may utilize different NF-kB members, and particularly the differential utilization of RELB may be a key mechanism for powerful inductions of NF-kB regulated genes in the intracellular dsRNA signaling pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».