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Enregistrement W2164640614 · doi:10.1086/657319

Comparative Metagenomic Study of Alterations to the Intestinal Microbiota and Risk of Nosocomial<i>Clostridum difficile</i>–Associated Disease

2010· article· en· W2164640614 sur OpenAlexafffundabout
Amee R. Manges, Aurélie Labbe, Vivian G. Loo, Juli Atherton, Marcel A. Behr, Luke Masson, Patricia Tellis, Roland Brousseau

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensNational Research Council CanadaDouglas Mental Health University InstituteMcGill UniversityBiotechnology Research InstituteMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Association of Gastroenterology
Mots-clésFirmicutesBacteroidetesClostridium difficileActinobacteriaProteobacteriaClostridiumMicrobiologyBiologyFecesGut floraAntibioticsInternal medicineGastroenterologyMedicineImmunologyBacteria16S ribosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study investigated the relationship between hospital exposures, intestinal microbiota, and subsequent risk of Clostridium difficile-associated disease (CDAD), with use of a nested case-control design. The study included 599 patients, hospitalized from September 2006 through May 2007 in Montreal, Quebec, from whom fecal samples were obtained within 72 h after admission; 25 developed CDAD, and 50 matched controls were selected for analysis. Nonsteroidal anti-inflammatory drugs and antibiotic use were associated with CDAD. Fecal specimens were evaluated by 16S ribosomal RNA microarray to characterize bacteria in the intestinal microbiota during the at-risk period. Probe intensities were higher for Firmicutes, Proteobacteria, and Actinobacteria in the patients with CDAD, compared with controls, whereas probe intensities for Bacteroidetes were lower. After epidemiologic factors were controlled for, only Bacteroidetes and Firmicutes remained significantly and independently associated with development of CDAD. Hospital exposures were associated with changes in the intestinal microbiota and risk of CDAD, and these changes were not driven exclusively by antimicrobial use.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,359
Score d'incertitude au seuil0,450

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations150
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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