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Enregistrement W2164707153 · doi:10.1128/cvi.00281-07

Serological Reactivity and Biochemical Characterization of Methylated and Unmethylated Forms of a Recombinant Protein Fragment Derived from Outer Membrane Protein B of <i>Rickettsia typhi</i>

2008· article· en· W2164707153 sur OpenAlexfundno aff
Chien‐Chung Chao, Zhiwen Zhang, Hui Wang, Abdulnaser Alkhalil, Wei‐Mei Ching

Notice bibliographique

RevueClinical and Vaccine Immunology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNaval Medical Research CenterCenters for Disease Control and PreventionUniversity of OttawaU.S. NavyU.S. Department of Defense
Mots-clésRickettsia typhiAntigenSerologyRecombinant DNAMolecular biologyBiologyWestern blotMethylationEscherichia coliAntibodyEpitopeMicrobiologyBiochemistryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rickettsia typhi, an obligate intracellular bacterium that causes murine typhus, possesses a heavily methylated outer membrane protein B (OmpB) antigen. This immunodominant antigen is responsible for serological reactions and is capable of eliciting protective immune responses with a guinea pig model. Western blot analysis of partially digested OmpB with patient sera revealed that most of the reactive fragments are larger than 20 kDa. One of these fragments, which is located at the N terminus (amino acids 33 to 273), fragment A (At), has been expressed in Escherichia coli. The expressed protein (rAt) was purified by chromatography and properly refolded by sequential dialysis. The refolded rAt protein was recognized by at least 87% of the typhus group patient sera as determined by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). However, the titers were lower than those obtained with OmpB of R. typhi. Since native OmpB is hypermethylated at lysine residues, we chemically methylated the lysine residues in rAt. The methylation was confirmed by amino acid composition analysis, and the methylation pattern of the methylated rAt (mrAt) protein was similar to that of native At from OmpB, as revealed by liquid chromatography-mass spectrometry analysis. Both rAt and mrAt were evaluated in an ELISA for their serological reactivity with patient sera. Among patient sera tested, 83% exhibited higher titers with mrAt than with rAt. These results suggest that rAt, with or without methylation, can potentially replace rickettsia-derived OmpB or whole-cell antigen for the diagnosis of R. typhi infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,424
Score d'incertitude au seuil0,738

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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