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Enregistrement W2164733444 · doi:10.1126/science.1213561

<i>Cyanophora paradoxa</i> Genome Elucidates Origin of Photosynthesis in Algae and Plants

2012· article· en· W2164733444 sur OpenAlexafffund
Dana C. Price, Cheong Xin Chan, Hwan Su Yoon, Eun Chan Yang, Huan Qiu, Andreas P.M. Weber, Rainer Schwacke, Jeferson Gross, Nicolas A. Blouin, Chris Lane, Adrián Reyes‐Prieto, Dion G. Durnford, Jonathan A. D. Neilson, B. Franz Lang, Gertraud Burger, Jürgen Steiner, Wolfgang Löffelhardt, Jonathan E. Meuser, Matthew C. Posewitz, Steven Ball, Maria Cecilia Arias, Bernard Henrissat, Pedro M. Coutinho, Stefan A. Rensing, Aikaterini Symeonidi, HarshaVardhan Doddapaneni, Beverley R. Green, Veeran D. Rajah, Jeffrey L. Boore, Debashish Bhattacharya

Notice bibliographique

RevueScience · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnergy
ThématiqueAlgal biology and biofuel production
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversité de MontréalUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyPlastidGenomeSister groupGeneBotanyNuclear geneAlgaeMitochondrial DNAEvolutionary biologyPlant evolutionPhylogenetic treeGeneticsChloroplastClade

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plastid Origins The glaucophytes, represented by the alga Cyanophora paradoxa , are the putative sister group of red and green algae and plants, which together comprise the founding group of photosynthetic eukaryotes, the Plantae. In their analysis of the genome of C. paradoxa , Price et al. (p. 843 ; see the Perspective by Spiegel ) demonstrate a unique origin for the plastid in the ancestor of this supergroup, which retains much of the ancestral diversity in genes involved in carbohydrate metabolism and fermentation, as well as in the gene content of the mitochondrial genome. Moreover, about 3.3% of nuclear genes in C. paradoxa seem to carry a signal of cyanobacterial ancestry, and key genes involved in starch biosynthesis are derived from energy parasites such as Chlamydiae. Rapid radiation, reticulate evolution via horizontal gene transfer, high rates of gene divergence, loss, and replacement, may have diffused the evolutionary signals within this supergroup, which perhaps explains previous difficulties in resolving its evolutionary history.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations382
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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