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Enregistrement W2164781110 · doi:10.1094/pdis-08-11-0697

Discovery of Potato Rot Nematode, <i>Ditylenchus destructor</i>, Infesting Garlic in Ontario, Canada

2012· article· en· W2164781110 sur OpenAlexaffabout
Qing Yu, M. A. Zaida, Becky R. Hughes, M. J. Celetti

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueNematode management and characterization studies
Établissements canadiensMinistry of Agriculture, Food and Rural AffairsUniversity of GuelphAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNematodeBulbPopulationRotylenchulus reniformisVeterinary medicineHorticultureBotanyEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Potato rot nematode, Ditylenchus destructor Thorne, 1945, is a serious nematode pest in a number of root and tube crops, primarily in potatoes, and is an internationally quarantined pest (2). In garlic, it was only reported in Japan (3). In 2011, a survey was conducted for the stem and bulb nematode, Ditylenchus dipsaci (Kühn) Filipjev in Ontario, Canada. PCR analysis revealed that a population of Ditylenchus from one garlic (Allium sativum) bulb sample in a 0.81-ha field (2-acre) in the Ottawa area had a significantly longer ITS1 (approximately 100 bp) than that of D. dipsaci. Subsequent morphology and DNA sequencing concluded that the population was Ditylenchus destructor, a quarantine species in Canada. Twenty females and twenty males were fixed and permanently mounted for morphological studies. The main diagnostic characters matched the description of D. destructor by Thorne (4). The female stylets had strong knobs, 11.1 ± 0.9 (10 to 12) μm long, lateral fields with six distinct lines in the middle section of the body, excretory pore 4.7 ± 1.3 (3 to 6) μm posterior to the hemizonid, esophageal base bulb overlaps dorsally with the intestine, post-vulval uterine sac extends up to two-thirds of the vulva-anus distance, and tail terminus finely rounded. A total of 20 nematode individuals were used for the molecular studies. They had 5-bp differences with the ITS1 (GenBank Accession No. EF208210; 650 bp) sequence of an isolate from Sihong County, China. The sequence of the partial 18S gene (GenBank Accession No. AY593912; 864 bp) was identical to the sequence of an isolate of D. destructor in the Netherlands. The detection of stem and bulb nematode was also confirmed from the field. Infested garlic plants were stunted and the basal bulbs became dark and somewhat rotten. Prior to this finding in Canada, D. destructor was only reported in a few isolated locations in the province of Prince Edward Island (PEI) in 1946 (1). The nematodes in PEI were effectively controlled. Another suspected case in British Columbia was not confirmed since the infested field had been known to be infested with D. dipsaci. To our knowledge, this is the first report of D. destructor on the mainland of Canada. The infested field has been subjected to strict quarantine measures to prevent the spread of the pest. Reference: (1) A. D. Baker et al. Sci. Agric. 26:138, 1946. (2) EPPO. No. 123. Data Sheets on Quarantined Organisms. Bulletin OEPP/EPPO Bull. 8, 1978. (3) T. Fujimura et al. Jpn. J. Nematol. 8:22, 1989. (4) G. Thorne. Proc. Helminthol. Soc. Wash. 12:27, 1945.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,263
Score d'incertitude au seuil0,303

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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