Phylogeny of <i>Flaveria</i> (Asteraceae) and inference of C<sub>4</sub> photosynthesis evolution
Notice bibliographique
Résumé
A well-resolved phylogeny of Flaveria is used to infer evolutionary relationships among species, biogeographical distributions, and C(4) photosynthetic evolution. Data on morphology, life history, and DNA sequences (chloroplastic trnL-F, nuclear ITS and ETS) for 21 of 23 known species were collected. Each data set was analyzed separately and in combination using maximum parsimony and Bayesian analyses. The phylogeny of Flaveria is based on the combined analysis of all data. Our phylogenetic evidence indicates that C(3) Flaveria are all basal to intermediate (C(3)-C(4) and C(4)-like) and fully expressed C(4) Flaveria species. Two strongly supported clades (A and B) are present. Using this phylogeny, we evaluate the current systematics of the genus and suggest the removal and reevaluation of certain taxa. We also infer the center of origin and dispersal of Flaveria species. Multiple origins of photosynthetic pathway intermediacy in Flaveria are recognized. C(3)-C(4) intermediacy has evolved twice in the genus and is found to be evolutionarily intermediate in clade A, but not necessarily in clade B. C(4)-like photosynthesis is also derived once in each clade. In addition, fully expressed C(4) photosynthesis may have evolved up to three times within clade A.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».