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Enregistrement W2164816398 · doi:10.1093/glycob/cwm126

Characterization of the  -2,8-polysialyltransferase from Neisseria meningitidis with synthetic acceptors, and the development of a self-priming polysialyltransferase fusion enzyme

2007· article· en· W2164816398 sur OpenAlexaff
Lisa M. Willis, Michel Gilbert, Marie-France Karwaski, M.-C. Blanchard, Warren W. Wakarchuk

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeisseria meningitidisPriming (agriculture)EnzymeFusionChemistryBiochemistryComputational biologyBiologyBacteriaGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycoconjugates containing polysialic acid have many biological activities and represent target molecules for therapeutic interventions. Enzymatic synthesis of these glycoconjugates should give access to these important molecules to evaluate their potential. The polysialyltransferases from both Neisseria meningitidis and Escherichia coli were cloned and expressed as recombinant proteins in E. coli. We have used synthetic acceptors to probe the acceptor requirement of these enzymes and to examine the basic enzymology. The minimum number of sialic acid residues (Neu5Ac) on the acceptor for activity in vitro was shown to be 2 for both enzymes, but a large increase in activity was seen if the acceptor had three Neu5Ac residues. The polysialyltransferase from N. meningitidis generated longer reaction products than the enzyme from E. coli on FCHASE acceptors. Examination of the products showed them to be a heterogeneous mixture, but products with >50 Neu5Ac residues could be seen using capillary zone electrophoresis analyses. In addition we made fusion proteins of these polysialyltransferase enzymes with the bifunctional alpha-2,3/alpha-2,8-sialyltransferase from Campylobacter jejuni to create self priming polysialyltransferases. These bifunctional sialyltransferases utilized various synthetic disaccharide acceptors with a terminal galactose, and we demonstrate here that the PST enzyme from N. meningitidis and its fusion protein with the C. jejuni sialyltransferase can be used to create polysialic acid on O-linked glycopeptides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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