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Enregistrement W2164840648 · doi:10.1016/j.crohns.2014.04.004

Novel de novo mutations of the interleukin-10 receptor gene lead to infantile onset inflammatory bowel disease

2014· article· en· W2164840648 sur OpenAlexaff
Cheng Hiang Lee, Peter Hsu, Brigitte Santner Nanan, Ralph Nanan, Melanie Wong, Kevin Gaskin, Rupert W. Leong, Ryan Murchie, Aleixo M. Muise, Michael Stormon

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensSickKids FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMissense mutationNonsense mutationMedicineMutationPeripheral blood mononuclear cellExonInterleukin 12 receptor, beta 1 subunitInflammatory bowel diseaseImmunologyAlleleInterleukin 10CytokineGeneticsDiseaseGeneBiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND AND AIMS: Defects in the interleukin 10 (IL-10) signalling pathway have been shown to cause very early onset inflammatory bowel disease (IBD). We report a patient with severe infantile-onset IBD with a compound heterozygous IL-10 receptor alpha subunit (IL-10RA) mutation, one of which was paternally-inherited and the other occurring de novo. METHODS: Deep sequencing of IL-10, IL-10RA and IL-10 receptor beta subunit (IL-10RB) were performed. Peripheral blood mononuclear cell (PBMC) surface expression of IL-10RA was analysed by flow cytometry. IL-10 signalling pathway was examined by measuring phosphorylated STAT3 in PBMC cultured in the presence of IL-6 or IL-10. RESULT: We identified a missense mutation in exon 4 of IL-10RA (c.583T>C) in one allele and a nonsense mutation in exon 7 of IL-10RA (c.1368G>T) in the other allele. Neither mutation has been reported previously. The patient has functional IL-10RA deficiency despite normal IL-10RA expression. CONCLUSION: This represents the first case report of a de novo mutation of IL-10RA that is associated with very early onset severe IBD. Therefore, IL-10 pathway defect should be considered in patients with infantile-onset IBD even if the parents are non-consanguineous.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,766
Score d'incertitude au seuil0,261

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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