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Enregistrement W2165013348 · doi:10.1139/g06-007

Genetic mapping of hop (<i>Humulus lupulus</i>L.) applied to the detection of QTLs for alpha-acid content

2006· article· en· W2165013348 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueGenome · 2006
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueHops Chemistry and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHumulus lupulusBiologyQuantitative trait locusAmplified fragment length polymorphismGeneticsGenetic linkageMicrosatelliteGenetic markerPopulationGene mappingGeneHorticultureAlleleGenetic diversity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The map locations and effects of quantitative trait loci (QTLs) were estimated for alpha-acid content in hop (Humulus lupulus L.) using amplified fragment length polymorphism (AFLP) and microsatellite marker (simple sequence repeat (SSR)) genetic linkage maps constructed from a double pseudotestcross. The mapping population consisted of 111 progeny from a cross between the German hop cultivar 'Magnum', which exhibits high levels of alpha-acids, and a wild Slovene male hop, 2/1. The progeny segregated quantitatively for alpha-acid content determined in 2002, 2003, and 2004. The maternal map consisted of 96 markers mapped on 14 linkage groups defining 661.90 cM of total map distance. The paternal map included 70 markers assigned to 12 linkage groups covering 445.90 cM of hop genome. QTL analysis indicated 4 putative QTLs (alpha1, alpha2, alpha3, and alpha4) on linkage groups (LGs) 03, 01, 09, and 03 of the female map, respectively. QTLs explained 11.9%-24.8% of the phenotypic variance. The most promising QTL to be used in marker-assisted selection is alpha2, the peak of which colocated exactly with the AFLP marker. Three chalcone synthase-like genes (chs2, chs3, and chs4) involved in hop bitter acid synthesis mapped together on LG04 of the female map. Saturation of the maps, particularly the putative QTL regions, will be carried out using SSR markers, and the stability of the QTLs will be tested in the coming years.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil0,396

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,355
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle