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Enregistrement W2165026201 · doi:10.1159/000437330

TNFAIP2 Inhibits Early TNFa-Induced NF-κB Signaling and Decreases Survival in Septic Shock Patients

2015· article· en· W2165026201 sur OpenAlexaff
Simone A. Thair, Elena Topchiy, John H. Boyd, Mihai Cîrstea, Catherine Wang, Taka‐aki Nakada, Christopher D. Fjell, Mark M. Wurfel, James A. Russell, Keith R. Walley

Notice bibliographique

RevueJournal of Innate Immunity · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSeptic shockTumor necrosis factor alphaSepsisMedicineCytokineGeneMinor allele frequencyGene expressionImmunologyDownregulation and upregulationBiologyCohortInternal medicineAlleleAllele frequencyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During septic shock, tumor necrosis factor alpha (TNFα) is an early response gene and induces a plethora of genes and signaling pathways. To identify robust signals in genes reliably upregulated by TNFα, we first measured microarray gene expression in vitro and searched methodologically comparable, publicly available data sets to identify concordant signals. Using tag single-nucleotide polymorphisms in the genes common to all data sets, we identified a genetic variant of the TNFAIP2 gene, rs8126, associated with decreased 28-day survival and increased organ dysfunction in an adult cohort in the Vasopressin and Septic Shock Trial. Similar to this cohort, we found that an association with rs8126 and increased organ dysfunction is replicated in a second cohort of septic shock patients in the St. Paul's Hospital Intensive Care Unit. We found that TNFAIP2 inhibits NF-x03BA;B activity, impacting the downstream cytokine interleukin (IL)-8. The minor G allele of TNFAIP2 rs8126 resulted in greater TNFAIP2 expression, decreased IL-8 production and was associated with decreased survival in patients experiencing septic shock. These data suggest that TNFAIP2 is a novel inhibitor of NF-x03BA;B that acts as an autoinhibitor of the TNFα response during septic shock.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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