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Enregistrement W2165047752 · doi:10.1091/mbc.e06-10-0884

Evolution of a Tumorigenic Property Conferred by Glycophosphatidyl-Inositol Membrane Anchors of Carcinoembryonic Antigen Gene Family Members during the Primate Radiation

2007· article· en· W2165047752 sur OpenAlexafffund
Fakhraddin Naghibalhossaini, Anne D. Yoder, Martin Tobi, Clifford P. Stanners

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchOak Ridge Associated Universities
Mots-clésBiologyCarcinoembryonic antigenGeneInositolAntigenCell biologyPrimateGeneticsCancer researchCancerNeuroscienceReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

GPI membrane anchors of cell surface glycoproteins have been shown to confer functional properties that are different from their transmembrane (TM)-anchored counterparts. For the human carcinoembryonic antigen (CEA) family, a subfamily of the immunoglobulin superfamily, conversion of the mode of membrane linkage from TM to GPI confers radical changes in function: from tumor suppression or neutrality toward inhibition of differentiation and anoikis and distortion of tissue architecture, thereby contributing to tumorigenesis. We show here that GPI anchorage in the CEA family evolved twice independently in primates, very likely from more primitive TM anchors, by different packages of mutations. Both mutational packages, one package found in many primates, including humans, and a second, novel package found only in the Cebidae radiation of New World monkeys, give rise to efficiently processed GPI-linked proteins. Both types of GPI anchors mediate inhibition of cell differentiation. The estimated rate of nonsynonymous mutations (Ka) in the anchor-determining domain for conversion from TM to GPI anchorage in the CEA family that were fixed during evolution in these primates is 7 times higher than the average Ka in primates, indicating positive selection. These results suggest therefore that the functional changes mediated by CEA GPI anchors, including the inhibition of differentiation and anoikis, could be adaptive and advantageous.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,361

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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