WIDESPREAD AND STRUCTURED DISTRIBUTIONS OF BLOOD PARASITE HAPLOTYPES ACROSS A MIGRATORY DIVIDE OF THE SWAINSON'S THRUSH (CATHARUS USTULATUS)
Notice bibliographique
Résumé
We examined the phylogenetic distribution of cytochrome b haplotypes of the avian blood parasite genera Haemoproteus and Plasmodium across the migratory divide of the Swainson's thrush (Catharus ustulatus) in British Columbia, Canada. From 87 host individuals, we identified 8 parasite haplotypes; 4 of Plasmodium and 4 of Haemoproteus. Six haplotypes were novel; 1 Haemoproteus haplotype was identical to H. majoris found in the blue tit (Parus caeruleus) in Sweden, and another halotype was identical to a Plasmodium haplotype found in the white-crowned sparrow (Zonotrichia leucophrys) in Oregon. The 2 most abundant parasite haplotypes were widely distributed across the contact zone, whereas 2 other parasite haplotypes seem to have structured distributions. Compared with 74 Plasmodium and Haemoproteus haplotypes published in GenBank, haplotypes recovered from Swainson's thrushes do not form monophyletic groups, and they are closely related to haplotypes from a variety of other hosts and localities. In addition, we recovered 2 Swainson's thrush Plasmodium haplotypes from the nonmigratory orange-billed nightingale thrush (Catharus aurantiirostris) in Costa Rica. This study is the first to elucidate avian blood parasite transmission, distribution, and phylogenetic relationships in an avian contact zone in North America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».