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Enregistrement W2165257492 · doi:10.1002/etc.5620210610

Methyltransferase: An enzyme assay for microbial methylmercury formation in acidic soils and sediments

2002· article· en· W2165257492 sur OpenAlexaff
Steven D. Siciliano, D. R. S. Lean

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMercury impact and mitigation studies
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMethylmercuryMercury (programming language)Environmental chemistryChemistryMicrocosmMethyltransferaseEnzyme assaySoil waterBioaccumulationWetlandMethylationEnzymeBiochemistryEcologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Methylmercury (MeHg) is a highly toxic form of mercury that bioaccumulates in aquatic food chains. However, methods to reliably identify sites of MeHg formation or to quantify MeHg production require the use of isotopic tracers, which limits their use. In this paper, a method is presented to quantify the methylation of mercury by a methyltransferase pathway. This methyltransferase pathway is one of the biochemical pathways responsible for biological mercury methylation. Protein is extracted from environmental samples, and mercury methyltransferase (HgMT) activity of soil extracts is calculated by assessing increases in methyltransferase activity induced by Hg addition. In enzyme extracts from pure cultures or soil samples, HgMT activity correlated with net MeHg production and Hg consumption, suggesting that HgMT activity can be used to estimate MeHg production in field samples. Over the course of a three-month period in a freshwater wetland, HgMT activity correlated with net MeHg concentrations (r2 = 0.55; p < 0.057). Furthermore, HgMT activity predicted (r2 = 0.80; p < 0.01) gross MeHg formation in freshwater wetlands as well as in laboratory microcosms calculated using previously published rate constants. Our results show that a methyltransferase assay, in combination with demethylation estimates, accurately predicts MeHg formation under field and laboratory conditions. This assay does not require the use of mercury added to field samples to estimate activity but rather estimates the biological activity present in the soil by quantifying the amount of enzyme present in the soil. Such an assay is well suited for use in field surveillance programs assessing MeHg formation in a variety of environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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