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Enregistrement W2165304530 · doi:10.1161/circgenetics.111.959817

Common Genetic Variation in the 3′- <i>BCL11B</i> Gene Desert Is Associated With Carotid-Femoral Pulse Wave Velocity and Excess Cardiovascular Disease Risk

2011· review· en· W2165304530 sur OpenAlexaff
Gary F. Mitchell, Germaine C. Verwoert, Kirill V. Tarasov, Aaron Isaacs, Albert V. Smith, Yasmin Yasmin, Ernst Rietzschel, Toshiko Tanaka, Ching‐Ti Liu, Afshin Parsa, Samer S. Najjar, Kevin M. O’Shaughnessy, Sigurður Sigurðsson, Marc De Buyzere, Martin G. Larson, Mark P.S. Sie, Jeanette S. Andrews, Wendy S. Post, Francesco Mattace‐Raso, Carmel M. McEniery, Guðný Eiríksdóttir, Patrick Segers, Ramachandran S. Vasan, Marie Josee E. van Rijn, Timothy D. Howard, Patrick F. McArdle, Abbas Dehghan, Elizabeth S. Jewell, Stephen Newhouse, Sofie Bekaert, Naomi M. Hamburg, Anne B. Newman, Albert Hofman, Angelo Scuteri, Dirk De Bacquer, M. Arfan Ikram, Bruce M. Psaty, Christian Fuchsberger, Matthias Olden, Louise V. Wain, Paul Elliott, Nicholas L. Smith, Janine F. Felix, Jeanette Erdmann, Joseph A. Vita, Kim Sutton‐Tyrrell, Eric J.G. Sijbrands, Serena Sanna, Lenore J. Launer, Tim De Meyer, Andrew D. Johnson, Anna FC Schut, David M. Herrington, Fernando Rivadeneira, Manuela Uda, Ian B. Wilkinson, Thor Aspelund, Thierry Gillebert, Luc Van Bortel, Emelia J. Benjamin, Ben A. Oostra, Jingzhong Ding, Quince Gibson, André G. Uitterlinden, Gonçalo R. Abecasis, John R. Cockcroft, Vilmundur Guðnason, Guy De Backer, Luigi Ferrucci, Tamara B. Harris, Alan R. Shuldiner, Cornelia M. van Duijn, Daniel Levy, Edward G. Lakatta, Jacqueline C.M. Witteman

Notice bibliographique

RevueCirculation Cardiovascular Genetics · 2011
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiovascular Health and Disease Prevention
Établissements canadiensGibson Energy (Canada)
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institutes of HealthBritish Heart Foundation
Mots-clésPulse wave velocityHazard ratioAlleleInternal medicineLocus (genetics)Arterial stiffnessMinor allele frequencyMedicinePulse pressureConfidence intervalCardiologyCoronary artery diseaseAllele frequencyGeneticsBlood pressureBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Carotid-femoral pulse wave velocity (CFPWV) is a heritable measure of aortic stiffness that is strongly associated with increased risk for major cardiovascular disease events. METHODS AND RESULTS: We conducted a meta-analysis of genome-wide association data in 9 community-based European ancestry cohorts consisting of 20 634 participants. Results were replicated in 2 additional European ancestry cohorts involving 5306 participants. Based on a preliminary analysis of 6 cohorts, we identified a locus on chromosome 14 in the 3'-BCL11B gene desert that is associated with CFPWV (rs7152623, minor allele frequency=0.42, β=-0.075±0.012 SD/allele, P=2.8×10(-10); replication β=-0.086±0.020 SD/allele, P=1.4×10(-6)). Combined results for rs7152623 from 11 cohorts gave β=-0.076±0.010 SD/allele, P=3.1×10(-15). The association persisted when adjusted for mean arterial pressure (β=-0.060±0.009 SD/allele, P=1.0×10(-11)). Results were consistent in younger (<55 years, 6 cohorts, n=13 914, β=-0.081±0.014 SD/allele, P=2.3×10(-9)) and older (9 cohorts, n=12 026, β=-0.061±0.014 SD/allele, P=9.4×10(-6)) participants. In separate meta-analyses, the locus was associated with increased risk for coronary artery disease (hazard ratio=1.05; confidence interval=1.02-1.08; P=0.0013) and heart failure (hazard ratio=1.10, CI=1.03-1.16, P=0.004). CONCLUSIONS: Common genetic variation in a locus in the BCL11B gene desert that is thought to harbor 1 or more gene enhancers is associated with higher CFPWV and increased risk for cardiovascular disease. Elucidation of the role this novel locus plays in aortic stiffness may facilitate development of therapeutic interventions that limit aortic stiffening and related cardiovascular disease events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations105
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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